Detecting riboSNitches with RNA folding algorithms: a genome-wide benchmark

Author:

Corley Meredith,Solem Amanda,Qu Kun,Chang Howard Y.,Laederach Alain

Publisher

Oxford University Press (OUP)

Subject

Genetics

Reference74 articles.

1. RNA structure prediction: an overview of methods;Seetin;Methods Mol. Biol.,2012

2. From consensus structure prediction to RNA gene finding;Bernhart;Brief. Funct. Genomic. Proteomic.,2009

3. Beyond Mfold: recent advances in RNA bioinformatics;Reeder;J. Biotechnol.,2006

4. Expanded sequence dependence of thermodynamic parameters improves prediction of RNA secondary structure;Mathews;J. Mol. Biol.,1999

5. On finding all suboptimal foldings of an RNA molecule;Zuker;Science,1989

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