除了上述付费会员服务以外，同舟云学术还可以为研究者个人或者研究机构提供个性化（订制化）服务（议价）。
（一）针对个人的个性化服务
1. 专家发现
依据用户自定义的检索词，通过我们的AI分析系统，为用户提供经过人工核查的前100名专家的详细信息，包括专家排名、论文总量、H指数、总得分，E-mail联系方式等。让用户了解自己或他人特定研究领域的地位、与相关领域专家进行学术交流活动。
2. 处理论文的共同第一、共同通讯作者
逐篇检查目标论文的全文，一般是研究者团队发表的论文，标注全部论文的共同第一作者、共同通讯作者信息。
3. 相似论文推送
4. 相似学者推荐
5. 论文被引提醒
随时通知学者本人的论文是否被他人引用，数据每天更新。
6. 前沿领域分析
通过分析本领域高被引论文的共被引、参考耦合信息，分析出本领域前沿研究的细分领域，帮助研究者调整研究方向。
7. 专业版学者对比功能
8. 专业版机构对比功能
（二）针对机构的个性化服务
1. 同舟云机构知识库
同舟云机构知识库的技术特点：
① 院系数据清洗：自动筛选和判别二级机构的成果，实现准确统计。系统能够智能匹配出机构的中英文异名及历史名称，第一、通讯作者机构成果统计均能达到与手工统计媲美；
② 学者数据清洗：语义挖掘+社会网络分析技术可精确区分同名作者。通过学者社交网络关系，系统能够区分同学院不同科系的同名学者，把中英文成果准确的匹配给每一位学者；
③ 先进的启发联想式技术，能够准确地把成果与学科进行匹配；
④ 支持多种成果数据类型，提供丰富的成果描述字段（120个以上）；
⑤ 管理后台功能强大且易于管理维护，确保机构知识库可长期持续发展。
经典案例：哈尔滨工业大学、南开大学、上海交通大学医学院、复旦大学上海医学院等。
2.同舟云机构学者库
同舟云机构学者库的技术特点：
① AI算法能够把同一学者不同历史阶段学习和工作单位发表的全部论文汇总，同时也能够辨识区分同名同姓同专业的不同学者；
② 无需学者本人干预，系统自动更新学者发表的中外文论文，算法准确率达到95%。
3.专题特色数据库
同舟云机构学者库的技术特点：
针对机构用户独有的专题特色信息资源或者用户对特定学科、专题信息资源的需求，为用户快速搭建专题特色数据库的建库平台。建设专题特色数据库的意义主要有两个方面，其一，保存、管理、揭示和利用机构特藏资源，让特藏特色资源发扬光大。其二，为了特定研究课题或特定需求有计划系统采集有关文献资源建立的专题数据库，如COVID-19专题数据库、疫苗研制技术专题数据库等。
经典案例：传染病学科专题资源库、心血管疾病专题资源库。
4.学术竞争力对标分析评价系统
系统的功能特点：
① 提供机构间的学术竞争力对标分析与评价：用户可以选择对标分析的对象机构，可同时选择多个机构进行横向比较，可任意选择对标分析的指标项（维度）；
② 提供学者间的学术竞争力对标分析与评价：用户可以选择n个学者进行对标分析评价，也可设置对标分析项；
③ 对标结果知识图谱可视化分析：对对标分析评价的数据进行知识图谱可视化分析，对标结果一目了然；
④ 可输出格式规范的对标分析评价报告：可以对机构/学者间的对标分析评价结果以规范报告的形式输出，可作为第三方评价报告供相关单位参考。
5.论文他引数据库
北京同舟云的论文被引信息，采集于论文官方地址中的参考文献。这使得我们的论文被引数据无论是从数量上，还是更新频率上，都优于国际上常用的商业数据公司，我们提供的论文引文数据不是零碎的而是完整的、动态持续更新的。论文他引数据库既可以一键导出全球任意学者的全部论文，同时一键列举和展示学者每篇论文所对应的被引频次、施引论文列表、自引频次以及自引论文列表等信息。利用该系统可获取任何论文的最新被引信息，它们的检索结果均可以按照论文最新被引频次排序。