Unifying evolutionary and thermodynamic information for RNA folding of multiple alignments

Author:

Seemann Stefan E.,Gorodkin Jan,Backofen Rolf

Publisher

Oxford University Press (OUP)

Subject

Genetics

Reference57 articles.

1. Fast Folding and Comparison of RNA Secondary Structures;Hofacker;Monatsh. Chemie,1994

2. Prediction of RNA secondary structure by energy minimization;Zuker;Methods Mol. Biol.,1994

3. CONTRAfold: RNA secondary structure prediction without physics-based models;Do;Bioinformatics,2006

4. A computational screen for mammalian pseudouridylation guide H/ACA RNAs;Schattner;RNA,2006

5. SnoReport: computational identification of snoRNAs with unknown targets;Hertel;Bioinformatics,2007

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