Técnicas multivariadas na determinação da diversidade genética em gergelim usando marcadores RAPD

Author:

Arriel Nair Helena Castro1,Di Mauro Antônio Orlando2,Di Mauro Sônia Marli Zingaretti2,Bakke Olaf Andreas3,Unêda-Trevisoli Sandra Helena2,Costa Marcelo Marchi2,Capeloto Andréa2,Corrado Amanda Roberta2

Affiliation:

1. Embrapa Algodão

2. Universidade Estadual Paulista

3. Universidade Federal de Campina Grande

Abstract

O objetivo deste trabalho foi comparar diferentes técnicas multivariadas na caracterização de 35 genótipos de gergelim mediante 769 marcadores RAPD. As distâncias genéticas foram obtidas pelo complemento aritmético do coeficiente de Jaccard e agrupadas pelos métodos hierárquicos do vizinho mais próximo, do vizinho mais distante, das médias aritméticas não ponderadas (UPGMA), do método de otimização de Tocher e análises de coordenadas principais. O agrupamento dos genótipos foi alterado em função dos diferentes métodos usados. Adotando-se a mesma distância genética (0,36) como valor de corte, diferenciaram-se quatro grupos no método do vizinho mais próximo, 13 para o vizinho mais distante, 11 no UPGMA e quatro no Tocher. Entre os métodos hierárquicos, o UPGMA apresentou o melhor ajuste das distâncias originais e estimadas (CCC = 0,89). As análises das coordenadas principais confirmaram a baixa diversidade existente entre os genótipos. A maior divergência ocorreu entre as cultivares Seridó 1 e Arawaca 4, e a menor, entre os genótipos VCR-101 e GP-3314. As três primeiras coordenadas principais contabilizaram 35,13% do total da variabilidade, e 18 autovalores foram necessários para explicar 81% da variação genética. Os métodos UPGMA, de otimização de Tocher, e as análises de coordenadas principais são complementares na formação dos grupos.

Publisher

FapUNIFESP (SciELO)

Subject

Agronomy and Crop Science,Animal Science and Zoology

Reference22 articles.

1. O agronegócio do gergelim no Brasil;ARRIEL N.H.C.,2001

2. Análise comparativa de quatro protocolos de extração de DNA genômico em Sesamum indicum L;ARRIEL N.H.C.;Revista Brasileira de Oleaginosas e Fibrosas,2002

3. Genetic variability in wheat (Triticum aestivum L.) germplasm revealed by RAPD markers;BERED F.;Crop Breeding and Applied Biotechnology,2002

4. Study of genetic diversity in Indian and exotic sesame (Sesamum indicum L.) germplasm using random amplified polymorphic DNA (RAPD) markers;BHAT K.V.;Euphytica,1999

5. Introdução à análise de agrupamentos;BUSSAB W. de O.,1990

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