Protocol for using heterologous spike-ins to normalize for technical variation in chromatin immunoprecipitation

Author:

Greulich FranziskaORCID,Mechtidou Aikaterini,Horn Teresa,Uhlenhaut Nina HenrietteORCID

Publisher

Elsevier BV

Subject

General Immunology and Microbiology,General Biochemistry, Genetics and Molecular Biology,General Neuroscience

Reference25 articles.

1. Differential peak calling of ChIP-seq signals with replicates with THOR;Allhoff;Nucleic Acids Res.,2016

2. Trimmomatic: a flexible trimmer for Illumina sequence data;Bolger;Bioinformatics,2014

3. Ensembl 2019;Cunningham;Nucleic Acids Res.,2019

4. The Encyclopedia of DNA elements (ENCODE): data portal update;Davis;Nucleic Acids Res.,2018

5. Gene Expression Omnibus: NCBI gene expression and hybridization array data repository;Edgar;Nucleic Acids Res.,2002

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