1. 1IAME, UMR1137, INSERM, Université Paris Diderot, Sorbonne Paris Cité, UFR de Medecine, 16 Rue Henri Huchard, Paris 75018, France
2. 2Department of Infectious Disease Epidemiology, Imperial College, London, W2 1PG, UK
3. 3APHP, Service de Microbiologie Clinique, Hôpital Avicenne, 93000, Bobigny, France
4. 4ISP, INRA, Université François Rabelais de Tours, UMR 1282, 37380 Nouzilly, France
5. 5Laboratoire de Biologie Moléculaire pour l'Etude des Génomes, (LBioMEG), CEA, Genoscope, Institut de Biologie François-Jacob, 9100, Evry, France
6. 6UMR8030, CNRS, Laboratoire d'Analyses Bioinformatiques pour la Génomique et le Métabolisme, CEA, Institut de Génomique – Genoscope, Université Évry-Val-d'Essonne, 91000, Evry, France
7. 7IAME, UMR 1137, INSERM, Université Paris Diderot, Université Paris13, Sorbonne Paris Cité, 75018, Paris, France
8. 8CIMI, UMR 1135, INSERM, Université Pierre et Marie Curie Sorbonne Université, 75013, Paris, France
9. 9APHP, Hôpital de la Pitié-Salpêtrière Service de Bactériologie-Hygiène, 75015, Paris, France