1. Unité de Recherche sur les Maladies Infectieuses Tropicales et Emergentes, UM63 CNRS 7278, IRD 189, Inserm U1095, IHU Méditerranée-Infection, Aix-Marseille Université, Marseille, France
2. These authors contributed equally to the work
3. Comité de Lutte contre les Infections Nosocomiales, Hôpital Nord, Assistance Publique-Hôpitaux de Marseille, Marseille, France
4. Service de Réanimation des Détresses Respiratoires et Infections Sévères, Hôpital Nord, Assistance Publique-Hôpitaux de Marseille, Marseille, France
5. Laboratoire de Microbiologie Clinique, Hôpital de la Timone, Assistance Publique-Hôpitaux de Marseille, Marseille, France
6. Aix Marseille Université, IRD French Institute of Research for Development, EHESP French School of Public Health, EPV UMR_D 190 'Emergence des Pathologies Virales', 13385, Marseille, France