Iniciadores utilizados en la identificación de virus de papiloma humano por PCR: una revisión

Abstract

Introducción La infección por el virus del papiloma humano (VPH) sigue siendo una de las más comunes en la población humana. Este virus cuenta con aproximadamente 200 genotipos diferentes, que se clasifican en términos de su capacidad oncogénica en alto y bajo riesgo. La identificación de estos genotipos se ha realizado mediante la técnica de la reacción en cadena de la polimerasa (PCR), la cual requiere el uso de iniciadores específicos para garantizar resultados precisos. Objetivo. Recopilar secuencias de iniciadores publicados, analizarlos y organizar esta información para proveer una lista compilada que facilite la decisión de optar por la utilización de un par de iniciadores requeridos para la detección y diagnóstico del HPV. Metodología. Se aplicó un enfoque cualitativo, de alcance descriptivo y con un diseño transversal teórico-documental, puesto que se analizó y sintetizó la literatura actualizada extraída de artículos científicos, relacionados con el tema de investigación, los cuales permitieron profundizar la investigación y cumplir con los objetivos planteados. Se revisaron varios artículos de publicación reciente que refieren los iniciadores utilizados. Resultados. Se muestran 17 iniciadores útiles para las variantes de alto riesgo 17 y 15 para las variantes 18, así como para otras variantes. Se expone de manera organizada diferentes aspectos a destacar en su análisis, así como características a tomar en cuenta para su diseño. Además, se mencionan las herramientas de análisis de secuencias las directrices y parámetros requeridos a considerar para asegurar una buena reacción de PCR. Es muy conveniente tomar en cuenta la clasificación taxonómica y estructura del VPH que permite comprender la utilización de un iniciador para un determinado gen del virus. Al momento de necesitar utilizar un determinado iniciador se sugiere tomar en cuenta los más convenientes según los valores obtenidos por las herramientas bioinformáticas y a los autores quienes probaron y publicaron secuencias de detección por PCR. Conclusión. Se muestran 17 iniciadores útiles para las variantes de alto riesgo 16 y 15 para las variantes 18, además de 8 para otros tipos. Además, se muestran parámetros de cada uno que permite tener criterios para decidir su selección.