HLYII HLYIIR BACILLUS CEREUS SENSU LATO HLYII-Reference-Cited by-同舟云学术

HLYII HLYIIR BACILLUS CEREUS SENSU LATO HLYII

Published:2024-03-22 Issue: Volume: Page:6-8
ISSN:
Container-title:Перспективные фундаментальные исследования и научные методы: сборник статей международной научной конференции (Выборг, Декабрь 2023)
language:
Short-container-title:

Author:

Егорова Надежда Александровна,Нагель Алексей Сергеевич,Солонин Александр Сергеевич

Abstract

В статье рассматривается распространение генов hlyII и hlyIIR , кодирующих гемолизин II и его регулятор, среди геномов Bacillus cereus sensu lato . На основе биоинформатического анализа природных участков ДНК, расположенных перед геном hlyII установлена консенсусная последовательность для оператора HlyIIR, выявлены консервативные и вариабильные участки, существенные в ДНК-белковом узнавании.

Publisher

Crossref

Reference9 articles.

1. Budarina ZI, Nikitin DV, Zenkin N, Zakharova M, Semenova E, Shlyapnikov MG, Rodikova EA, Masyukova S, Ogarkov O, Baida GE, Solonin AS, Severinov K. A new Bacillus cereus DNA-binding protein, HlyIIR, negatively regulates expression of B. cereus haemolysin II. Microbiology. 2004, Nov; 150(Pt 11):3691-701. PubMed PMID: 15528656.

2. Kovalevskiy OV, Lebedev AA, Surin AK, Solonin AS, Antson AA. Crystal structure of Bacillus cereus HlyIIR, a transcriptional regulator of the gene for pore-forming toxin hemolysin II. J Mol Biol. 2007 Jan 19;365(3):825-34. doi: 10.1016/j.jmb.2006.10.074. Epub 2006 Oct 26. PMID: 17097673; PMCID: PMC1828608.

3. Wattam, A. R., Davis, J. J., Assaf, R., Boisvert, S., Brettin, T., Bun, C., Conrad, N., Dietrich, E. M., Disz, T., Gabbard, J. L., Gerdes, S., Henry, C. S., Kenyon, R. W., Machi, D., Mao, C., Nordberg, E. K., Olsen, G. J., Murphy-Olson, D. E., Olson, R., Overbeek, R., … Stevens, R. L. (2017). Improvements to PATRIC, the all-bacterial Bioinformatics Database and Analysis Resource Center. Nucleic acids research, 45(D1), D535-D542. https://doi.org/10.1093/nar/gkw1017

4. Olson, R. D., Assaf, R., Brettin, T., Conrad, N., Cucinell, C., Davis, J. J., Dempsey, D. M., Dickerman, A., Dietrich, E. M., Kenyon, R. W., Kuscuoglu, M., Lefkowitz, E. J., Lu, J., Machi, D., Macken, C., Mao, C., Niewiadomska, A., Nguyen, M., Olsen, G. J., Overbeek, J. C., … Stevens, R. L. (2023). Introducing the Bacterial and Viral Bioinformatics Resource Center (BV-BRC): a resource combining PATRIC, IRD and ViPR. Nucleic acids research, 51(D1), D678-D689. https://doi.org/10.1093/nar/gkac1003

5. Baida G, Budarina ZI, Kuzmin NP, Solonin AS. Complete nucleotide sequence and molecular characterization of hemolysin II gene from Bacillus cereus. FEMS Microbiol Lett. 1999 Nov 1; 180(1):7-14. PubMed PMID: 10547438