1. Service de Pneumologie et Oncologie Thoracique
2. Service de Pneumologie et Allergologie Pédiatriques, Hôpital Femme-Mère-Enfant, Hospices Civils de Lyon, Bron
3. Service de Maladies Infectieuses et Tropicales, Hôpital de la Croix-Rousse, Hospices Civils de Lyon
4. Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM) U1111 Centre International de Recherche en Infectiologie (CIRI), Université Claude Bernard Lyon I
5. Laboratoire de Microbiologie, Centre Hospitalier Lyon Sud, Hospices Civils de Lyon, Pierre Bénite
6. Unité Mixte de Recherche Centre National de la Recherche Scientifique 5558, Laboratoire de Biométrie et Biologie Évolutive, Villeurbanne
7. Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Pitié-Salpêtrière, Laboratoire de Bactériologie-Hygiène, Centre National de Référence des Mycobactéries et de la Résistance des Mycobactéries aux Antituberculeux, Sorbonne Universités, Unité de Phytopharmacie et Médiateurs Chimiques University Paris 06, CR7, INSERM, U1135, Centre d'Immunologie et des Maladies Infectieuses, Team 13 (Bacteriology), Fra