SMS: Smart Model Selection in PhyML

Author:

Lefort Vincent1,Longueville Jean-Emmanuel1,Gascuel Olivier12

Affiliation:

1. Institut de Biologie Computationnelle, LIRMM, UMR 5506 - CNRS et Université de Montpellier, Montpellier, France

2. Unité de Bioinformatique Evolutive, C3BI, USR 3756 - Institut Pasteur et CNRS, Paris, France

Publisher

Oxford University Press (OUP)

Subject

Genetics,Molecular Biology,Ecology, Evolution, Behavior and Systematics

Reference9 articles.

1. ProtTest: selection of best-fit models of protein evolution;Abascal;Bioinformatics,2005

2. Genome-wide heterogeneity of nucleotide substitution model fit. Genome;Arbiza;Biol Evol,2011

3. jModelTest 2: more models, new heuristics and parallel computing;Darriba;Nat Methods,2012

4. BIONJ: an improved version of the NJ algorithm based on a simple model of sequence data;Gascuel;Mol Biol Evol.,1997

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