1. GHU AP-HP, Sorbonne Université, Service des Maladies Infectieuses et Tropicales, Hôpital Saint-Antoine , Paris , France
2. Sorbonne Université, INSERM, Institut Pierre Louis d’Épidémiologie et de Santé Publique , Paris , France
3. Département de Prévention, Diagnostic et Traitement des Infections, Hôpital Henri Mondor , AP-HP, Créteil , France
4. LABGeM, Génomique Métabolique, Genoscope, Institut François Jacob, CEA, CNRS, Université Paris-Saclay , Evry , France
5. Institut de Médecine et d’Epidémiologie Appliquée , Paris , France
6. Sorbonne University, INSERM, Centre d’Immunologie et des Maladies Infectieuses , CIMI Team 13, Paris , France
7. GHU AP-HP, Sorbonne Université, Département de Microbiologie, Hôpital Saint-Antoine , Paris , France
8. EA 7380 Dynamyc, Université Paris-Est Créteil, Créteil , France