NCBI prokaryotic genome annotation pipeline

Author:

Tatusova Tatiana,DiCuccio Michael,Badretdin Azat,Chetvernin Vyacheslav,Nawrocki Eric P.,Zaslavsky Leonid,Lomsadze Alexandre,Pruitt Kim D.,Borodovsky Mark,Ostell James

Publisher

Oxford University Press (OUP)

Subject

Genetics

Reference36 articles.

1. GeneMarkS: a self-training method for prediction of gene starts in microbial genomes. Implications for finding sequence motifs in regulatory regions;Besemer;Nucleic Acids Res.,2001

2. Improved microbial gene identification with GLIMMER;Delcher;Nucleic Acids Res.,1999

3. The COG database: new developments in phylogenetic classification of proteins from complete genomes

4. The National Center for Biotechnology Information's Protein Clusters Database

5. Infernal 1.1: 100-fold faster RNA homology searches

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