Mieux connaître les virus présents sur Terre grâce aux métagénomes

Abstract

En dépit de leur très grand nombre, les virus qui peuplent l’environnement restent largement méconnus. Les approches de métagénomique ont permis depuis vingt ans de mieux connaître la composition des communautés virales naturelles, notamment les groupes viraux les plus fréquemment trouvés, et de lever peu à peu le voile sur l’étendue de leur diversité, révélant le grand nombre d’espèces, de genres et même de familles virales, pour la plupart identifiés pour la première fois. Au sein de ces groupes, le contenu en gènes, les hôtes infectés et les écosystèmes habités sont souvent cohérents avec l’histoire évolutive, reflet de l’origine très ancienne des virus et de leur très longue coévolution avec leurs hôtes, plus que de leur capacité à muter rapidement.