Đa dạng di truyền của họ gene OsHKT ở 41 giống lúa địa phương Đồng bằng sông Cửu Long
-
Published:2021-12-28
Issue:6
Volume:57
Page:224-230
-
ISSN:2815-5599
-
Container-title:Can Tho University Journal of Science
-
language:
-
Short-container-title:CTUJSVN
Author:
Văn Quốc Giang,Trần In Đô,Nguyễn Văn Mạnh,Nguyễn Thành Tâm,Huỳnh Như Điền,Lê Thị Hồng Thanh,Huỳnh Kỳ
Abstract
OsHKT là họ gene đóng vai trò quan trọng trong cơ chế chống chịu mặn của cây lúa. Trong nghiên cứu này, các đoạn DNA của hai nhóm gene OsHKT1 và OsHKT2 từ 41 giống lúa địa phương vùng ĐBSCL đã được giải trình tự, nhằm tìm ra mối tương quan di truyền giữa các giống lúa. Kết quả cho thấy, sự đa hình được thể hiện nhiều nhất ở hai gene OsHKT1;5 và OsHKT2;1 với tất cả 41 giống lúa cho sự đa hình ở gene OsHKT1;5 và 25 giống lúa đối với gene OsHKT2;1. Kết quả này là cơ sở cho các nghiên cứu tiếp theo về khả năng chống chịu mặn liên quan đến họ gene OsHKT của các giống lúa địa phương vùng Đồng bằng sông Cửu Long.
Publisher
Can Tho University
Reference23 articles.
1. Almeida, P., Katschnig, D., & de Boer, A. H. (2013). HKT transporters--state of the art. Int J Mol Sci, 14(10), 20359-20385. doi:10.3390/ijms141020359 2. Amrutha, R. N., Sekhar, P. N., Varshney, R. K., & Kishor, P. B. K. (2007). Genome-wide analysis and identification of genes related to potassium transporter families in rice (Oryza sativa L.). Plant Science, 172(4), 708-721. doi:https://doi.org/10.1016/j.plantsci.2006.11.019 3. Bafeel, S. (2013). Phylogeny of the Plant Salinity Tolerance Related HKT Genes. Intl. J. Biol., 5, 64-68. doi:10.5539/ijb.v5n2p64 4. Bouckaert, R., Vaughan, T. G., Barido-Sottani, J., Duchêne, S., Fourment, M., Gavryushkina, A., Heled, J., Jones, G., Kühnert, D., De Maio, N., Matschiner, M., Mendes, F. K., Müller, N. F., Ogilvie, H. A., du Plessis, L., Popinga, A., Rambaut, A., Rasmussen, D., Siveroni, I., Suchard, M. A., Wu, C. H., Xie, D., Zhang, C., Stadler, T., & Drummond, A. J. (2019). BEAST 2.5: An advanced software platform for Bayesian evolutionary analysis. PLOS Computational Biology, 15(4), e1006650. doi:10.1371/journal.pcbi.1006650 5. Cotsaftis, O., Plett, D., Johnson, A. A., Walia, H., Wilson, C., Ismail, A. M., Close, T. J., Tester, M., & Baumann, U. (2011). Root-specific transcript profiling of contrasting rice genotypes in response to salinity stress. Mol Plant, 4(1), 25-41. doi:10.1093/mp/ssq056
|
|