1. Nguyên lý: Các chấtkháng sinh có thể khuếch tán trên môi trường thạch, ức chế vi sinh vật mẫn cảm với chúng và tạo thành vòng vô khuẩn. Ngược lại, những vi khuẩn nào có khả năng kháng với chất kháng sinh sẽ sinh trưởng và phát triển bình thường và không bị ức chế bởi kháng sinh. Đường kính vòng vô khuẩn thể hiện mức độ mẫn cảm của vi khuẩn với từng loại kháng sinh thử nghiệm.
2. Hình 2: Sơ đồ phương pháp kiểm tra khả năng kháng kháng sinh của các dòng vi khuẩn nội sinh được tuyển chọn
3. Đánh giá kết quả: Khả năng kháng thuốc kháng sinh được đánh giá theo 3 mức độ, dựa vào đường kính vòng vô khuẩn ở các mức độ khác nhau gồm: Mức độ kháng(K): ≤13 mm, mức độ trung gian (T): 14 - 16 mm và mức độ nhạy cảm (N): ≥17 mm.
4. Sau khi khảo sát khả năng kháng khuẩn của các dòng vi khuẩn đã phân lập, chọn 3 dòng có đặc tính kháng khuẩn cao để giải trình tự gen 16S-rRNA. Trình tự nhận được dùng để so sánh với dữ liệu trên ngân hàng gene NCBI (National Center forBiotechnology Information) bằng chương trình BLAST để định danh vi khuẩn.
5. Các số liệu thu được được xử lý bằng phần mềm Excel 2007 và phần mềm thống kê Statgraphics plusXV.