Türkiye Patates Yetiştirme Alanlarından Toplanan Meloidogyne chitwoodi'nin Moleküler Karakterizasyonu ve Filogenisi-Reference-Cited by-同舟云学术

Türkiye Patates Yetiştirme Alanlarından Toplanan Meloidogyne chitwoodi'nin Moleküler Karakterizasyonu ve Filogenisi

Published:2022-01-12 Issue: Volume: Page:
ISSN:2619-9149
Container-title:Kahramanmaraş Sütçü İmam Üniversitesi Tarım ve Doğa Dergisi
language:tr
Short-container-title:KSU J. Agric Nat.

Author:

ASLAN Ayşenur¹,DİNÇER Dilek²,BEHMAND Tohid³,ÖZARSLANDAN Adem⁴,ÖZTÜRK Lerzan⁵,ELEKCİOĞLU İbrahim Halil⁶

Affiliation:

1. ATATURK UNIVERSITY, FACULTY OF AGRICULTURE, DEPARTMENT OF PLANT PROTECTION

2. Biyolojik Mücadele Araştırma Enstitüsü

3. ÇUKUROVA ÜNİVERSİTESİ, ZİRAAT FAKÜLTESİ, BİTKİ KORUMA BÖLÜMÜ

4. MERSİN ÜNİVERSİTESİ, SİLİFKE MESLEK YÜKSEKOKULU

5. Bağcılık Araştırma Enstitüsü

6. ÇUKUROVA ÜNİVERSİTESİ, ZİRAAT FAKÜLTESİ, BİTKİ KORUMA BÖLÜMÜ, BİTKİ KORUMA PR.

Abstract

Meloidogyne chitwoodi, birçok Avrupa ülkesinde zarara neden olan istilacı bir nematoddur. Bu tür, Türkiye'nin kuzey, batı ve doğu bölgelerinde patates yetiştirme alanlarında sorunlara neden olmaktadır. Bitki paraziti nematodlarının tanımlanması temelde morfolojik özelliklerin ve morfometrik parametrelerin gözlenmesiyle gerçekleştirilmesiyle yapılmakta fakat, bu yöntemlerde benzer özelliklere sahip birkaç türün varlığından dolayı tanımlama güçlükleri bulunmaktadır. Yayınlanmış orijinal betimlemeler ve tanılama anahtarlarının kullanılmasıyla her zaman doğru tespit yapılamamaktadır. Bu nedenle, bu çalışmada patates örneklerinden izole edilen Meloidogyne chitwoodi örnekleri, JMVhapla-JMV1-JMV2 primer setleri ile A PCR tabanlı tanı yöntemi ile moleküler olarak ve morfolojik olarak tanımlanmıştır. PCR reaksiyonları sonucu % 2 agaroz jel elektroforezinde 540 bp bantlar elde edilmiştir. Ayrıca çalışmada yerel popülasyonların diğer Meloidogyne türleri ile ilişkilerini araştırmak için için filogenetik analiz ve ikili uzaklık değerlendirilmesi yapılmıştır. Bu amaçla, M. chitwoodi'nin DNA sekansları, BLAST kullanılarak GenBank sekans karşılaştırmasına tabi tutulmuştur. Filogeni çalışmalarından sonra popülasyonların M. chitwoodi Türkiye popülasyonuna % 99 ve diğer popülasyonlara % 99 benzer olduğu tespit edilmiştir. Yayınlanmış yerel izolatların diğer sekansları ile karşılaştırıldığında bu çalışmadaki izolat, Nevşehir (KF557791.1) izolatı ile oldukça benzerlik göstermiştir.

Publisher

KSU Journal of Agriculture and Nature

Subject

General Medicine

Reference21 articles.

1. Adam MAM, Phillips MS, Blok VC 2007. Molecular Diagnostic Key For Identification Of Single Juveniles Of Seven Common And Economically Important Species Of Root-Knot Nematode (Meloidogyne spp.). Plant Pathology 56(1): 190-197.

2. Anonymous 2005. Meloidogyne chitwoodi and Meloidogyne fallax. Bulletin OEPP, 34(2): 315-320.

3. Chitwood BG 1949. “Root-Knot Nematodes” -Part I. A Revision of the Genus Meloidogyne Goeldi, 1887. Proceedings of the Helminthological Society of Washington 16(2): 90-104.

4. Çalışkan ME, Onaran H, Arıoğlu H 2010. Overview of the Turkish Potato Sector: Challenges, Achievements and Expectations. Potato Research 53(4): 255–266.

5. Devran Z, Mutlu N, Özarslandan A, Elekcioğlu İH 2009. Identification and Genetic Diversity of Meloidogyne chitwoodi in Potato Production Areas of Turkey. Nematropica 39(1): 75-83.