Detection, Characterization, and Monitoring of Plum pox virus in Zonguldak Province

Author:

MORCA Ali Ferhan1,COŞKAN Sevgi2,AKBAŞ Birol2

Affiliation:

1. ANKARA ZİRAİ MÜCADELE MERKEZ ARAŞTIRMA ENSTİTÜSÜ MÜDÜRLÜĞÜ

2. Zirai Mücadele Merkez Araştırma Enstitüsü Müdürlüğü

Abstract

Plum pox virus (PPV) Türkiye’de ilk olarak 1968 yılında Edirne ilinde tespitinden sonra ülkenin farklı bölgelerinde birçok meyve bahçesinde saptanmıştır. Ülkesel keşif ve takip sürveyleri kapsamında PPV’nin varlığının araştırılması için Zonguldak ilinde 2019-2021 yılları arasında toplam 2539 örnek toplanmıştır. Toplanan örnekler içinde aynı ev bahçesine ait 6 adet erik ağacının yapılan DAS-ELISA ve RT-PCR sonucunda PPV ile enfekteli olduğu belirlenmiştir. Enfekteli olduğu belirlenen 6 adet izolatın P3, 6K1, CI ve CP gen bölgelerini içeren toplam 1533 nükleotitlik diziler GenBank’a kaydedilmiştir. Zonguldak PPV-izolatlarına ait diziler ile yapılan BlastN analizi sonucunda yüksek benzerlik oranı ile PPV-M ırkına ait olduğu belirlenmiştir. Enfekteli izolatlar için Maximum Likelihood (ML), Maximum Parsimony (MP) ve Bayesian Inference (BI) yöntemleri ile gerçekleştirilen filogenetik ağaçta da PPV-M ırkı ile kümelendiği gözlemlenmiştir. Enfekteli ağaçların imhasından sonra da aynı lokasyon ve bütün ilde yapılan sistematik sürveyler ve laboratuvar analizlerine iki yıl süre ile devam edilmiştir. Yapılan yoğun takip sürveyleri çerçevesinde ve laboratuvar analizleri sonucunda, Zonguldak ilindeki bahçelerin PPV’den arındırılması sağlanmış ve 1 km çapındaki alanda tampon bölge oluşturulmuştur. Tampon bölge içerisinde 3 yıl süreyle Prunus türlerinin yetiştiriciliği yasaklanmış, takip ve gözlem çalışmaları sonucunda bölgenin virüsten ari olması sağlanmıştır.

Publisher

KSU Journal of Agriculture and Nature

Subject

General Medicine

Reference38 articles.

1. Akbaş B, Değirmenci K, Ciftci O, Kaya A, Yurtmen M, Uzunoğullari N, Çelik N, Türkölmez Ş 2011. Update on Plum pox virus distribution in Turkey. Phytopathologia Mediterranea 50(1): 75-83.

2. Anonim 2017. Şarka virüsü, plum pox potyvirus-PPV sürvey talimatı. (Erişim tarihi: 11/10/2021).

3. Atanasoff D 1933. Plum pox. A new virus disease. Annu. Univ. Sofia Fac. Agron. Sylvic. 11: 49–70.

4. Birişik N, Morca AF, Erilmez S, Çiftçi O, Yurtmen M, Uzunoğulları N, Deligöz İ, Şahin M, Öntepeli ML 2021. Türkiye'de Plum pox virus’ un altı yıllık ülkesel sürvey ve eradikasyon programının değerlendirilmesi. Bitki Koruma Bülteni 61(2): 19-32.

5. Cambra M, Boscia D, Myrta A, Palkovics L, Navrátil M, Barba M, Gorris MT Capote N 2006. Detection and characterization of Plum pox virus: serological methods. Bull. OEPP 36(2): 254–261. http://dx.doi.org/10.1111/j.1365-2338.2006.00983.x.

同舟云学术

1.学者识别学者识别

2.学术分析学术分析

3.人才评估人才评估

"同舟云学术"是以全球学者为主线,采集、加工和组织学术论文而形成的新型学术文献查询和分析系统,可以对全球学者进行文献检索和人才价值评估。用户可以通过关注某些学科领域的顶尖人物而持续追踪该领域的学科进展和研究前沿。经过近期的数据扩容,当前同舟云学术共收录了国内外主流学术期刊6万余种,收集的期刊论文及会议论文总量共计约1.5亿篇,并以每天添加12000余篇中外论文的速度递增。我们也可以为用户提供个性化、定制化的学者数据。欢迎来电咨询!咨询电话:010-8811{复制后删除}0370

www.globalauthorid.com

TOP

Copyright © 2019-2024 北京同舟云网络信息技术有限公司
京公网安备11010802033243号  京ICP备18003416号-3