Detekciya razlichnyh form poteri gena SMN1 s pomoshch'yu nabora dlya PCR-RV

Abstract

Proksimal'naya spinal'naya myshechnaya atrofiya 5q (5q-SMA) — autosomno-recessivnoe nervno-myshechnoe zabolevanie, harakterizuyushcheesya poterej dvigatel'nyh nejronov v perednih rogah spinnogo mozga. S 2023 g. SMA vklyuchena v obyazatel'nyj neonatal'nyj skrining na territorii Rossijskoj Federacii. Neonatal'nyj skriningovyj test na 5q-SMA dolzhen vyyavlyat' vse tipy gomozigotnoj poteri gena SMN1. Cel'yu issledovaniya byla sravnitel'naya ocenka vozmozhnosti opredeleniya gomozigotnoj poteri ekzona 7 gena SMN1 s pomoshch'yu testa na osnove PCR-RV s metodom MLPA u pacientov s 5q-SMA, a takzhe c razlichnymi izmeneniyami chisla kopij gena SMN1. S pomoshch'yu nabora bylo proanalizirovano 206 obrazcov DNK (gruppa 1), vydelennyh i ochishchennyh iz cel'noj krovi, i 135 obrazcov DNK (gruppa 2), vydelennyh i ochishchennyh iz suhih pyaten krovi, s izvestnym kolichestvom kopij genov SMN1 i SMN2. Kolichestvo kopij genov SMN1 i SMN2 opredelyali metodom MLPA, kotoryj byl vybran v kachestve referensnogo metoda. Pokazano, chto nabor obnaruzhivaet gomozigotnuyu poteryu gena SMN1 vo vsekh obrazcah, u kotoryh podtverzhdena gomozigotnaya poterya gena SMN1 s pomoshch'yu MLPA (gruppa 1: n = 67; 33%; gruppa 2: n = 19; 14%). V to zhe vremya vo vsekh obrazcah s 1–3 kopiyami gena SMN1 rezul'taty nabora byli otricatel'nymi (gruppa 1: n = 139; 67%; gruppa 2: n = 116; 86%). Nabor demonstriruet vysokuyu effektivnost' i pozvolyaet obnaruzhivat' vse vozmozhnye molekulyarnye formy gomozigotnoj poteri gena SMN1 kak v obrazcah DNK, vydelennyh iz cel'noj krovi, tak i iz suhih pyaten krovi.