Sravnitel'nyj bioinformaticheskij analiz sostava genov antimikrobnoj ustojchivosti v genomah predstavitelej roda Corynebacterium

Abstract

V nastoyashchee vremya mnozhestvennaya antimikrobnaya rezistentnost' bakterial'nyh infekcionnyh agentov predstavlyaet ser'eznuyu ugrozu dlya mirovogo zdravoohraneniya. Osoboe znachenie v razvitii infekcij, v tom chisle gospital'nyh, igrayut sleduyushchie vidy korinebakterij: C. amycolatum, C. urealyticum, C. striatum, C. jeikeium, C. aurimucosum, C. genitalium, kotorye ustojchivy k bol'shomu arsenalu antimikrobnyh preparatov. Cel'yu issledovaniya bylo provedenie bioinformaticheskogo analiza spektra genov ustojchivosti k antimikrobnym preparatam v opublikovannyh genomah nekotoryh predstavitelej roda Corynebacterium. Issledovany dannye o nukleotidnyh posledovatel'nostyah polnyh genomov 22 shtammov korinebakterij, predstavlennyh v svobodnom dostupe v NCBI GenBank. Bioinformaticheskij analiz polnogenomnyh posledovatel'nostej s cel'yu poiska genov antimikrobnoj ustojchivosti v ukazannyh genomah osushchestvlyali s pomoshch'yu onlajn-resursa PATRIC. Ustanovleno, chto predstavlennye genomy v razlichnyh kombinaciyah soderzhali 25 genov ustojchivosti k antimikrobnym preparatam. U nekotoryh shtammov korinebakterij vyyavleny aminokislotnye zameny v GyrA (pozicii 87, 88 i 91), s kotorymi mozhet byt' svyazana realizaciya ustojchivosti k hinolonam/ftorhinolonam.