Comparison of Three DNA Extraction Methods for Detection Echinococcus granulosus Isolated from Sheep and Cows

Abstract

Background: Hydatosis caused by Echinococcus granulosus dog tap worm is zoonotic infection and economic importance and to public health constitutes a major threat in certain regions of the Middle East. There is an establishment of preventive and control strategy for characterization of E.granulosus in all endemic area which is essential in all molecular studies, to check the DNA of the parasite.Objective: Our study aimed to obtain the best from three extractions DNA methods from hydatid cyst protoscolecses isolated from sheep in Al-shawlla abattoir in Baghdad.Subjects and Methods: Three methods were used to extract DNA samples (boiling, crushing and commercial) DNA samples were performed with electrophoreses on 1.3% agarose. Regarding DNA for methods were compared by time and facility and cost-effectiveness.Results: The most method was boiling and crushing DNA extraction because of their easy, quickness besides the commercial kit method which had good bands on gel electrophoresis but had most cost effectiveness and time.Conclusion: The most method were boiling and crushing using for DNA extraction   مقارنة لثلاث طرق لأستخلاص الدنا الخاص بدودة المشوكات الحبيبية المعزولة من الأغنام والأبقار    د. دنيا نجم الدين أحمد د. سلوى صبر محسن   د. عبدالله لفتة جياد   الخلاصه: المقدمه: مرض الأكياس المائية يتسبب عن الأصابة بدودة الكلب( المشوكة الحبيبية)وله أهمية من الناحية كونها تسبب عدوى حيوانية مشتركة مما تؤثر على الناحية الأقتصادية والصحة العامة يشكل رئيسي وهذا ما يهدد مناطق محددة من الشرق الآوسط وهذه المناطق الموبؤة بدودة المشوكات الحبيبية "ولابد من  وضع استراتيجية للوقاية والتحكم .مما يتطلب وصف المشوكة الحبيبية في جميع الدراسات الجزيئية للتحري عن الدنا الموجود في هذا الطفيلي . الأهداف : تهدف الدراسة الى تحديد الأفضل من طرق أستخلاص الثلاثة( قيد الدراسة)  لدنا الأكياس المائية  لطفيلي المشوكات الحبيبية التي تم جمعها من الأغنام والأبقار من مجزرة الشعلة في مدينة بغداد .   طريقة العمل  : تم أستخدام ثلاث طرق لأستخلاص عينات من الحمض النووي الدنا وهي طريقة الغليان والسحق والعدة التجارية ورحلت النتائج على 1.3% من جل الأكاروز , وفيما يتعلق بطرق الأستخلاص للحامض النووي قورنت من ناحية الوقت والتكلفة ومدى الدقة ووضوح الدنا المستخلص . النتائج : الطرق التي كانت الأحسن في أستخلاص الدنا هي طريقة الغليان وطريقة السحق لأنها سهلة وسريعة بالأضافة الى الطريقة التي تستخدم العدة التجارية التي تعطي حزم جيدة للحمض النووي الدنا أثناء الترحيل الكهربائي لكنها ذات تكلفة عالية وتأخذ وقت . الأستنتاجات : الطرق الأحسن أستخداما لأستخلاص الحمض النووي الدنا هي طريقتي الغليان والسحق   مفتاح الكلمات: طرق استخلاص الدنا، الاكياس المائية، المشوكات الحبيبية