MİKROSKOBİK GÖRÜNTÜLERDE MULTİPL MİYELOM PLAZMA HÜCRELERİNİN TESPİTİ

Abstract

Multipl Miyelom, dünyada kansere bağlı ölümlerin yaklaşık %2’sine sebep olan bir hastalıktır. Bu hastalık nedeniyle normalde vücudun bağışıklık sistemi için antikor üreten plazma hücrelerinin sayısı kontrolsüz bir şekilde artmaktadır. Dolayısıyla plazma hücrelerin tespiti hastalığın teşhisi için önemli bir faktördür. Uzmanlar tarafından hastalığın teşhisi için kemik iliğinden örnekler alınarak kimyasal boyama teknikleriyle boyanmaktadır. Boyanan örneklerdeki plazma hücreleri mikroskopla incelenmektedir. Bu inceleme insan hatalarına açık olduğu gibi aynı zamanda çok zaman almaktadır. Bu çalışmada plazma hücrelerinin tespiti için otomatik bir sistem geliştirilmiştir. Plazma hücrelerinin tespiti için hücre çekirdeği ve sitoplazması farklı yöntemlerle ayrı ayrı segmente edilmiştir. Hücre çekirdeğine ait bölgeler Çok Seviyeli Eşikleme yöntemiyle, sitoplazması ise U-net evrişimsel sinir ağı kullanılarak segmente edilmiştir. Segmente edilen bölgeler uygulanan morfolojik işlemlerle iyileştirilmiştir. Segmente edilen çekirdek ve sitoplazma bölgelerinin birlikte değerlendirildiği görüntülerdeki her bir hücre için Çekirdek Hücre Oranı kriterine göre plazma hücreleri tespit edilmiştir. Veri setine ait 85 görüntü üzerinde önerilen yöntem uygulandığında, toplam 320 plazma hücresinden 279’u başarılı bir şekilde tespit edilmiştir. Çalışma sonucunda %87,19 duyarlılık, %74,6 kesinlik ve %80,4 F1-skor değerleri elde edilmiştir.