Bazı yeni N-sübstitüe amino asit esterlerinin yapısal özelliklerinin in silico ile araştırılması
Author:
ÇALIŞIR Ümit1ORCID, ÇİÇEK Baki2ORCID
Affiliation:
1. SİİRT ÜNİVERSİTESİ 2. Balıkesir Üniversitesi
Abstract
Bu çalışma kapsamında oldukça önemli biyolojik kullanım alanlarına sahip N-sübstitüe glisin ester bileşiklerinin bazı teorik (hesapsal) özellikleri HyperChem programı yardımıyla hesaplanmıştır. HyperChem programı kullanılarak etil 9-{[(2-etoksi-2-oksoetil)amino]etil}-4-okso-3-oksa-6,9,12-triazatetradekan-14-oat (1), dietil 3,6,9,12,15-pentaazaheptadekan-1,17-dioat (2), ve etil 2-((6-metil-2-piridinil)amino)asetat (3) bileşiklerinin bağ uzunlukları, toplam yük yoğunluğu ve yük dağılımı, elektrostatik potansiyelleri belirlenmiştir. En kararlı yapıları üzerinden bazı enerji parametreleri ile HOMO, LUMO, ve ΔE orbitalleri hesaplanmıştır. Elde edilen verilerden yararlanılarak iyonlaşma potansiyeli belirlenmiştir. Ayrıca teorik elektronik UV spektrumu ve geçiş değerleri hesaplanmıştır. Bu yöntemle hesaplanmış teorik UV spektrumu ve geçiş değerleri, deneysel olarak elde edilen UV-VİS spektrumu karşılaştırılarak kıyaslanmıştır. Teorik ve deneysel verilerin uyumlu oldukları tespit edilmiştir. Bileşiklerin reaktivitesi ile ilişkili olan ΔE değerinin, (3) bileşiğinde oldukça düşük olduğu belirlenmiştir (8.8559 eV).
Publisher
Balikesir Universitesi Fen Bilimleri Enstitusu Dergisi
Subject
General Engineering
Reference35 articles.
1. Çalışır, Ü. ve Çiçek, B., Synthesis, characterization and determination of some theoretical properties of ethyl 2-((4,6-dimethylpyrimidin-2- yl)amino)acetate, Proceedings, III. International Siirt Conference on Scientific, 686–696, ISPEC Publishing House, (2022). 2. Culf, A. S. ve Ouellette, R. J., Solid-phase synthesis of N-substituted glycine oligomers (alpha-peptoids) and derivatives, Molecules, 15, 5282–5335, (2010). 3. Seo, J., Lee, B.-C. ve Zuckermann, R. N., Peptoids: Synthesis, Characterization, and Nanostructures, Comprehensive Biomaterials, 53–76, Elsevier, (2011). 4. Wetzer, M., Kapoor, R., Huang, W. ve Barron, A. E., Peptoid Oligomers: Peptidomimetics for Diverse Biomedical Applications, Polymer Science: A Comprehensive Reference, 267–287, Elsevier, (2012). 5. Bolt, H. L., Kleijn, L. H. J., Martin, N. I. ve Cobb, S. L., Synthesis of antibacterial nisin–peptoid hybrids using click methodology, Molecules, 23, 1–9, (2018).
|
|