Revisión sistemática de la situación epidemiológica y análisis genómico del SARS-CoV-2 aislado de perros y gatos domésticos

Abstract

Se realizó una revisión sistemática sobre la epidemiología de la infección por SARS-CoV-2 en caninos y felinos domésticos, así como el análisis genómico de las muestras del virus secuenciadas de perros y gatos. La revisión sistemática se estructuró a partir del protocolo PRISMA. Los artículos se obtuvieron empleando las palabras clave SARS-CoV-2, COVID-19, perros, gatos, epidemiología, transmisión animal, mascotas, animales de compañía, reservorios animales y zoonosis. Adicionalmente, se seleccionaron todos los genomas del SARS-CoV-2 aislados y secuenciados de perros y gatos reportados en la base de datos EpiCoV™ de la plataforma GISAID. Los genomas se analizaron a través de la herramienta Nextclade para la generación de los árboles filogenéticos respectivos. Los reportes de exposición - infección natural con SARS-CoV-2 abarcaron entre enero de 2020 a octubre de 2021 e incluyeron a 100 perros y 108 gatos positivos a la prueba RTq-PCR. Además, se aislaron 141 secuencias genéticas de SARS-CoV-2 de perros (50) y gatos (91), encontrando las siguientes variantes monitoreadas por las organizaciones de salud pública: las variantes preocupantes (VOC) Alpha, Gamma y Delta, y las variantes de interés (VOI) Iota y Lambda. El linaje viral B.1. ha sido predominantemente aislado y secuenciado tanto en perros como en gatos (13.3%), siendo Norteamérica la región con mayor cantidad de genomas reportados de SARS-CoV-2 en ambas especies (43.6%). El SARS-CoV-2 tiene la capacidad de infectar caninos y felinos domésticos, siendo de interés en salud pública su exposición a VOC: Alpha, Gamma y Delta, y las VOI: Iota y Lambda; probablemente por un efecto “spillover” desde el humano. Sin embargo, estas dos especies tienen baja capacidad de transmitir el virus a otras especies susceptibles, considerando que pueden actuar como un fondo de saco epidemiológico en la dinámica de transmisión del SARS-CoV-2.