Efecto de marcadores genéticos moleculares en genes inducibles por hipoxia de bovinos criollos y Brown Swiss criados en los Andes de Perú

Abstract

Los genomas de 41 bovinos de cinco razas existentes en la base de datos del SRA-NCBI, fueron usados para identificar 17 polimorfismos de nucleótido simple (PNSs), los cuales generan mutaciones no sinónimas en 10 genes inducibles por hipoxia. De ese total, solo tres PNSs ubicados en las posiciones c.1081G>C, c.2089G>A y c.2101G>A de los exones 7 y 12 del gen EPAS1 tuvieron frecuencias alélicas diferentes entre bovinos cárnicos y lecheros (p<0.05). Basados en los resultados del análisis bioinformático de los genomas, se eligieron regiones exónicas de los genes EPAS1, NOS2, EPO y VEGFA, que fueron estudiadas en 60 muestras de ADN de bovinos criollos y Brown Swiss criados en la región altoandina (3213-4309 msnm). Los bovinos fueron agrupados por su concentración de hemoglobina (Hb) en Brown Swiss con Hb alta (BSHbA) (n=13), Brown Swiss con Hb baja (BSHbB) (n=11), criollos con Hb alta (CRHbA) (n=13) y criollos con Hb baja (CRHbB) (n=12); además se tuvo un grupo de Brown Swiss con mal de altura (BSMA) (n=11). Los amplicones generados fueron secuenciados con la metodología Sanger, identificándose 10 PNSs. No se encontraron asociaciones entre estos PNSs y los grupos considerados. Únicamente un PNS ubicado en la posición intrόnica Cr.19: 19403681T>C del gen NOS2 tuvo frecuencia diferente entre bovinos criollos y Brown Swiss (p<0.05); además dicho PNS se encontró ligado a otros dos que están ubicados en el exón 12 del mismo gen.