Study of the Karachay Population Based on the Analysis of Ten Polymorphic DNA Loci-Reference-Cited by-同舟云学术

Study of the Karachay Population Based on the Analysis of Ten Polymorphic DNA Loci

Published:2024-07-08 Issue:2 Volume:60 Page:51-62
ISSN:0016-6758
Container-title:Генетика
language:
Short-container-title:Genetika

Author:

Petrova N. V.¹,Marakhonov A. V.¹,Balinova N. V.¹,Vasilyeva T. A.¹,El’chinova G. I.¹,Ginter E. K.¹,Zinchenko R. A.¹

Affiliation:

1. Research Centre for Medical genetics

Abstract

Genetic structure of Karachai population has been studied based on analysis of 10 autosomal DNA markers (diallelicand multiallelic): CCR5∆32, ACE, D7S23(KM19) STR/THOI, STR/FABP, STR/IVS6a, VNTR/PAH, VNTR/DAT1, VNTR/eNOS VNTR/APOB. The total number of sample makes up 485 individuals who are residents of five Karachai regions: Karachaevsky, Prikubansky, Malokarachayevsky, Ust-Dzhegutinsky and the city of Cherkessk, the capital of the Republic of Karachaevo-Cherkessia. Analysis of allele’s frequency of autosomal DNA markers in Karachay geographic subgroups shows considerable genetic differentiation between them. The highest level of genetic diversity for Karachay people on dialle system is set at the locus ID/ACE, Hobs = 0.513, on multi-allele system isat the locus STR/THOI, Hobs = 0.792. The average value of the observed heterozygosity per locus is 0.466, varying from 0.441 in Ust-Dzhegutinsky to 0.503 in Cherkessk. The level of genetic differences between Karachai groups (FST = 0.007) is inside the variance defined in the previously studied peoples, Mari (FST = 0.0024), Udmurt (FST = 0.0048), Chuvash (FST = 0.006), Tatars (FST = 0.0075) and Bashkir (FST = 0.008).

Publisher

The Russian Academy of Sciences

Reference26 articles.

1. Карачай – страна на вершине Кавказа. Очерки истории и культуры Карачая. Составление, вступительная статья и комментарии С.Х. Хотко. Майкоп: ОАО “Полиграф-ЮГ”, 2011. 448 с.

2. Алексеева Е.П. Карачаевцы и балкарцы – древний народ Кавказа. Черкесск, 1963. 86с. (http://www.elbrusoid.org/upload/iblock/8fc/karacay-balkar-drev-narod_turklib.pdf)

3. Ахметова В.Л., Хусаинова Р.И., Юрьев Е.Б. и др. Анализ полиморфизма девяти ДНК-локусов ядерного генома в популяции марийцев // Генетика. 2006. Т. 42. № 2. С. 256‒273.

4. Бермишева М.А., Петрова Н.В., Зинченко Р.А и др. Популяционно-генетическое исследование популяции удмуртов (анализ десяти полиморфных ДНК-локусов ядерного генома) // Генетика. 2007. Т. 43. № 5. С. 688‒705.

5. Гринберг Я.И., Гринберг Э.Р., Ахметова В.Л. и др. Медико-генетическое изучение населения Республики Башкортостан. Сообщ. VI. Популяционно-генетическое изучение этногеографических групп башкир (анализ десяти полиморфных ДНК-локусов ядерного генома) // Мед. генетика. 2010. Т. 9. № 2(92). С. 12‒29.