Hibridização reversa e sequenciamento na genotipagem do vírus da hepatite C

Author:

Levada Patrícia Martinez1,Moraes Camila Fernanda Verdichio de1,Corvino Silvia Maria1,Grotto Rejane Maria Tommasini2,Silva Giovanni Faria1,Pardini Maria Inês de Moura Campos2

Affiliation:

1. Universidade Estadual Paulista

2. Universidade Estadual Paulista; Universidade Estadual Paulista

Abstract

INTRODUÇÃO: Os métodos de genotipagem do vírus da hepatite C têm sido muito discutidos. O objetivo deste trabalho foi comparar as metodologias de hibridização reversa e sequenciamento direto para a genotipagem do vírus da hepatite C. MÉTODOS: Noventa e uma amostras de plasma de pacientes assistidos na Faculdade de Medicina de Botucatu da Universidade Estadual Paulista foram utilizadas. A genotipagem por hibridização reversa foi realizada utilizando o kit comercial INNO-LiPA® v.1.0. O sequenciamento direto foi efetuado em sequenciador automático utilizando protocolos in house. RESULTADOS: A genotipagem por sequenciamento direto mostrou-se eficiente na resolução dos resultados inconclusivos pelo kit comercial. O kit mostrou resultados errôneos em relação à subtipagem viral. Além disso, a genotipagem por sequenciamento direto revelou um erro do kit com relação à determinação genotípica questionando a eficiência do método também para a identificação do genótipo viral. CONCLUSÕES: A genotipagem realizada por meio de sequenciamento direto permite uma maior acurácia na classificação viral quando comparada à hibridização reversa.

Publisher

FapUNIFESP (SciELO)

Subject

Infectious Diseases,Microbiology (medical),Parasitology

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1. Platelets can be a biological compartment for the Hepatitis C Virus;Brazilian Journal of Microbiology;2015-06

2. HCV genotype 4 circulating in the city of Franca, São Paulo state, Brazil;Brazilian Journal of Infectious Diseases;2011-06

3. HCV genotype 4 circulating in the city of Franca, São Paulo State, Brazil;The Brazilian Journal of Infectious Diseases;2011-05

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