1. Centre Interdisciplinaire de Recherches Médicales de Franceville (CIRMF), Franceville BP 769, Gabon
2. CNRS, Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive UMR5558, Université de Lyon 1, 69622 Villeurbanne, France
3. LabEx ECOFECT, Eco-Evolutionary Dynamics of Infectious Diseases, Université de Lyon 1, 69622 Villeurbanne, France
4. Laboratoire MIVEGEC, UMR-CNRS 5290-IRD 224, IRD Montpellier, 34394 Montpellier, France
5. Centre National de Référence des Staphylocoques, Institut des Agent infectieux, Hôpital de la Croix Rousse, Hospices Civils de Lyon, 69004 Lyon, France
6. Laboratoire de Bactériologie, Observatoire Rhône-Alpes des Mycobactéries, Institut des Agents Infectieux, Hospices Civil, 69004 Lyon, France
7. Centre International de Recherche en Infectiologie, INSERM U1111, CNRS UMR5308, Université de Lyon 1, ENS de Lyon, Hospices Civil Lyon, 69004 Lyon, France