Linear mixed model selection in forest tree breeding studies

Author:

ACET Mehmet1ORCID,ÖLMEZ Zafer2ORCID

Affiliation:

1. Orman Ağaçları ve Tohumları Islah Araştırma Enstitüsü Müdürlüğü

2. ARTVİN ÇORUH ÜNİVERSİTESİ, ORMAN FAKÜLTESİ, ORMAN MÜHENDİSLİĞİ BÖLÜMÜ

Abstract

Orman ağacı ıslah çalışmalarında, uzun süre gözlemlenen genetik testler ile ıslah programları için genetik parametreler tahmin edilmektedir. Söz konusu parametrelerin tahminleri ıslah programını etkileyeceğinden tahmin için kullanılacak doğrusal karma modelin seçimi büyük önem taşımaktadır. Kullanılan doğrusal karma modellerde tahmin, genellikle artık (residual) veya kısıtlı maksimum olabilirlik (REML) yöntemi kullanılarak elde edilir. Farklı sabit etkileri olan modellerin olabilirliğe (likelihood) dayalı bilgi kriterleri ile kıyaslanabilmesi için, modellerin maksimum olabilirlik (maximum likelihood) kullanılarak tahmin edilmesi önerilmektedir. Orman ağaçları ıslahı çalışmalarında doğrusal karma model seçiminde farklı modeller denenerek model uyumunu arttıran en kullanışlı model seçilmelidir. Orman ağaçları ıslah çalışmalarında modellerin uyumunu kıyaslamak için ise genellikle Akaike (AIC) bilgi kriterinin kullanılması önerilmektedir. Bu çalışmada, doğrusal karma model seçiminin gerekliliğini ve önemini ortaya koymak amaçlanmıştır. Bu amaç için, Muğla-Marmaris’te açık tozlaşma ürünü 168 aile (üvey kardeş) ile tesis edilmiş olan Kızılçam döl deneme sahasındaki ağaçların on ikinci yaş göğüs yüksekliği çap verileri kullanılarak modeller kıyaslanmıştır. Verilerin analizinde geleneksel (basit), mekânsal bileşen içeren, artığın bağımsız veya birinci dereceden iki boyutlu ayrılabilir otoregresif korelasyon hata yapısı olduğunu varsayan toplamda otuziki farklı model denenmiştir. Geleneksel modelin AIC değeri (Model-1=5594.1), mekânsal bileşen ve artığın otoregresif korelasyon yapısı içeren modellere kıyasla (Model-20=5447) daha yüksek bulunmuştur

Funder

Orman Genel Müdürlüğü Orman Ağaçları ve Tohumları Islah Araştırma Enstitüsü Müdürlüğü

Publisher

Artvin Coruh Universitesi Orman Fakultesi Dergisi

Subject

General Medicine

Reference38 articles.

1. Alan M, Öztürk H, Şıklar S, Ezen T, Korkmaz B, Doğan B, Keskin S, Tulukçu M, Derilgen SI, Çalışkan B (2005) Ege bölgesi alt yükselti kuşağı ıslah zonunda (0-400 m) Kızılçam (Pinus brutia ten.) döl denemeleri 4. yaş sonuçları. (Teknik Bülten:13), Orman Ağaçları ve Tohumları Islah Araştırma Enstitüsü Müdürlüğü, Ankara.

2. Aparicio J, Ariza-Suarez D, Raatz B (2019) Web application for spatial modelling of field trials. Paper presented at the XXIX Simposio Internacional de Estadística, Barranquilla

3. Borges A, González-Reymundez A, Ernst O, Cadenazzi M, Terra J, Gutiérrez L (2019) Can spatial modeling substitute for experimental design in agricultural experiments? Crop Science, 59(1):44-53

4. Bozdogan H (1987) Model selection and Akaike's information criterion (AIC): The general theory and its analytical extensions. Psychometrika, 52(3):345-370

5. Brown H, Prescott R (2015) Applied mixed models in medicine. John Wiley & Sons, New York

同舟云学术

1.学者识别学者识别

2.学术分析学术分析

3.人才评估人才评估

"同舟云学术"是以全球学者为主线,采集、加工和组织学术论文而形成的新型学术文献查询和分析系统,可以对全球学者进行文献检索和人才价值评估。用户可以通过关注某些学科领域的顶尖人物而持续追踪该领域的学科进展和研究前沿。经过近期的数据扩容,当前同舟云学术共收录了国内外主流学术期刊6万余种,收集的期刊论文及会议论文总量共计约1.5亿篇,并以每天添加12000余篇中外论文的速度递增。我们也可以为用户提供个性化、定制化的学者数据。欢迎来电咨询!咨询电话:010-8811{复制后删除}0370

www.globalauthorid.com

TOP

Copyright © 2019-2024 北京同舟云网络信息技术有限公司
京公网安备11010802033243号  京ICP备18003416号-3