Impact on disease mortality of clinical, biological, and virological characteristics at hospital admission and overtime in COVID‐19 patients

Author:

Yazdanpanah Yazdan12ORCID,DIALLO Alpha3,PAUL Christelle3,MERCIER Noémie3,LE MESTRE Soizic3,PETROV‐SANCHEZ Ventzislava3,ANDREJAK Claire4,CHIROUZE Catherine5,MALVY Denis6,DEPLANQUE Dominique7,DUBOS François7,ROSSIGNOL Patrick8,ETIENNE Manuel9,ROSSIGNOL Bénédicte10,LEVY‐MARCHAL Claire10,GILG Morgane10,GIGANTE Tristan10,Marine BELUZE11,HULOT Jean‐Sebastien12,CHAIR Anissa13,KHALIL Antoine13,VISSEAUX Benoit13,COUFFIGNAL Camille13,ROY Carine13,LAOUÉNAN Cédric13,DA SILVEIRA Charlene13,TARDIVON Coralie13,BACHELET Delphine13,DESCAMPS Diane13,MENTRÉ France13,BOMPART François13,LESCURE François‐Xavier13,PEYTAVIN Gilles13,GORENNE Isabelle13,HOFFMANN Isabelle13,GHOSN Jade13,Christophe LUCET Jean13,TIMSIT Jean‐François13,MULLAERT Jimmy13,BHAVSAR Krishna13,BOUADMA Lila13,TAGHERSET Lysa13,TELLIER Marie‐Capucine13,DEBRAY Marie‐Pierre13,ESPOSITO‐FARESE Marina13,SCHNEIDER Marion13,LE Minh13,ETTALHAOUI Nadia13,SI MOHAMMED Nassima13,GAULT Nathalie13,PEIFFER‐SMADJA Nathan13,KEFIF Ouifiya13,ELOY Philippine13,LE HINGRAT Quentin13,KALI Sabrina13,LARIBI Samira13,TUBIANA Sarah13,TRIOUX Théo13,DUVAL Xavier13,VANEL Noémie14,PICONE Olivier15,BASMACI Romain15,ANGOULVANT François16,KAGUELIDOU Florentia17,PAGES Justine17,VEISLINGER Aurélie18,TUAL Christelle18,PAPADOPOULOS Aurélie19,ESPEROU Hélène19,JAAFOURA Salma19,COUFFIN‐CADIERGUES Sandrine19,COELHO Alexandra20,HOCTIN Alexandre20,DIOUF Alphonsine20,MAMBERT Marina20,GAYMARD Alexandre21,LINA Bruno21,ROSA‐CALATRAVA Manuel21,BOUSCAMBERT Maude21,TERRIER Olivier21,MEZIANE Amina22,DORIVAL Céline22,BENKEROU Dehbia22,TÉOULÉ François22,LINGAS Guillaume23,LE NAGARD Hervé23,GUEDJ Jérémie23,NEANT Nadège23,ABEL Laurent24,KHAN Coralie25,DESVALLÉE Mathilde25,WIEDEMANN Aurélie26,LEVY Yves26,MOUQUET Hugo27,BEHILILL Sylvie27,van der WERF Sylvie27,ENOUF Vincent27,SEMAILLE Caroline28,d'ORTENZIO Eric28,CERVANTES‐GONZALEZ Minerva28,PUÉCHAL Oriane28,NORET Marion29,RORIZ Mélanie30,RISPAL Patrick30,REDL Sarah30,LEFEBVRE Laurent31,GRANIER Pascal31,MAULIN Laurence31,JOSEPH Cédric32,MOYET Julien32,LION‐DAOLIO Sylvie32,MAHIEU Rafael33,DUCANCELLE Alexandra33,DUBEE Vincent33,SALLABERRY Stéphane34,MANUEL Aldric34,MACHEDA Gabriel34,MAILLET Mylène34,CHANZY Bruno34,GAGNARD Jean‐Charles35,GIORDANO Guillermo36,MOUTON PERROT Clara36,PESTRE Vincent36,FICKO Cécile37,GOMINET Marie37,BOUSQUET Aurore37,VAUCHY Charline38,BOUILLER Kévin38,PAGADOY Maïder38,MARTY‐QUINTERNET Solène38,LEPILLER Quentin38,LE BRIS Cyril39,THILL Benoit39,CASANOVA Marie‐Laure39,LE FALHER Georges39,OZIOL Eric39,CORDEL Hugues40,DOURNON Nathalie40,BOUCHAUD Olivier40,BRICHLER Ségolène40,NGUYEN Duc41,BELLECAVE Pantxika41,CICCONE Camille41,LAFON Marie‐Edith41,GREFFE Ségolène42,BOUISSE Camille43,SEDILLOT Nicholas43,BOUHOUR Damien43,CHASSIN Camille44,L'HER Erwan45,ANSART Séverine45,TROMEUR Cécile45,GUELLEC Dewi45,MERCKX Antoine46,DJOSSOU Felix47,PEIGNE Vincent48,PIEROBON Carola48,CARRET Marie‐Christine48,JEGO Florence48,ISNARD Margaux48,AUCHABIE Johann49,COURTOIS Roxane49,LESENS Olivier50,MARTINOT Martin51,PICONE Olivier52,LACOSTE Marie53,ELHARRAR Brigitte54,GARRAIT Valérie54,DELACROIX Isabelle54,MAITRE Thomas54,Baptiste ASSIE Jean54,NYAMANKOLLY Elsa55,Xavier CATHERINE François56,BLOT Mathieu56,MAHY Sophie56,BUISSON Marielle56,PIROTH Lionel56,GUILLOTIN Florence56,DE ROUGEMONT Alexis56,CAMPANA Valentine57,PASQUIER Jérémie57,CABIE André57,BESSIS Simon58,EPAULARD Olivier59,TERZI Nicolas59,PAYEN Jean‐François59,BOUILLET Laurence59,HAMIDFAR Rebecca59,Le MARECHAL Marion59,MACHADO Moïse60,BARRELET Audrey60,BEDOSSA Alexandra60,COLIN Gwenhaël61,DECOURS Romain61,GUIMARD Thomas61,GOUJARD Cécile62,JAUREGUIBERRY Stéphane62,CHERET Antoine62,Sophie RESSEGUIER Anne63,POISSY Julien64,MATHIEU Daniel64,NSEIR Saad64,ENGELMANN Ilka64,REMY Martine64,VUOTTO Fanny65,GACHET Benoit65,FAURE Karine65,BOYER‐BESSEYRE Marielle65,Enagnon Kazali65,LAMBERT Marc66,SCHERPEREEL Arnaud66,DEPLANQUE Dominique66,FRY Stéphanie66,YELNIK Cécile66,BITKER Laurent67,MEZIDI Mehdi67,YONIS Hodane67,BENECH 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Jean‐Benoît82,SANCHEZ Olivier82,MANDA Victoria83,AZEMAR Laurène83,CASTOR‐ALEXANDRE Guylaine83,LACOMBE Karine84,CHIARABINI Thibault84,LEFEBVRE Bénédicte84,MORAND‐JOUBERT Laurence84,FOFANA Djeneba84,SCHNURIGER Aurélie84,DE CASTRO Nathalie85,DELAUGERRE Constance85,CHAIX Marie‐Laure85,CHAS Julie86,GABORIEAU Valérie87,LE COUSTUMIER Eve87,PICARD Walter87,ZABBE Jean‐Benoît88,PEELMAN Florent88,SOUM Edouard88,AUMAÎTRE Hugues89,CURLIER Elodie90,OUISSA Rachida90,FABRE Isabelle90,RAMMAERT Blandine91,SAIDANI Nadia92,BANI‐SADR Firouzé93,HENTZIEN Maxime93,N'GUYEN Yohan93,ROMARU Juliette93,DIDIER Kévin93,ENDERLE Isabelle94,THIBAULT Vincent94,LAINE Fabrice94,LESOUHAITIER Matthieu94,REVEST Matthieu94,TATTEVIN Pierre94,PLANTIER Jean‐Christophe95,ETIENNE Manuel95,LEMEE Véronique95,FERRAND DEVOUGE Eglantine95,ALEXANDRE Kévin95,ARTAUD‐MACCARI Elise95,ALLOU Nathalie96,LAGRANGE Marie96,JABOT Julien96,ROZE Benoît97,BREGEAUD Delphine97,AIT TAMLIHAT Younes97,HACHEMI Ali98,SALVATOR Hélène99,FOURN Erwan99,ZUCMAN David99,DELAVEUVE Eric100,JAUD‐FISCHER Coline100,DUNAND Paul100,BISSUEL François101,DELAVIGNE Karen102,PIEL‐JULIAN Marie102,DELOBEL Pierre102,SARTON Benjamine102,RAFIQ Marie102,MARTIN‐BLONDEL Guillaume102,GUILLEMINAULT Laurent102,MURRIS Marlène102,SOMMET Agnès102,SENNEVILLE Eric103,ROBINEAU Olivier103,MEYBECK Agnès103,GAROT Denis104,PLANTIER Laurent104,GISSOT Valérie104,MARLET Julien104,STEFIC Karl104,GAUDY‐GRAFFIN Catherine104,BARIN Francis104,LEMAIGNEN Adrien104,CORVAISIER Grégory105,LARIVIERE Delphine105,LANGELOT‐RICHARD Marie105,BOTELHO‐NEVERS Elisabeth106,GAGNEUX‐BRUNON Amandine106,TROUILLON Tiffany106,BOURLET Thomas106,BOURLET Thomas106,PILLET Sylvie106,POZZETTO Bruno106,KIMMOUM Antoine107,LEVY Bruno107,MATTEI Mathieu107,GOEHRINGER François107,RABAUD Christian107,BEVILACQUA Sibylle107,LEFEVRE Benjamin107,GUILLAUMOT Anne107,VENARD Véronique107,JEULIN Hélène107,SCHVOERER Evelyne107,HARTARD Cédric107,CARAUX PAZ Pauline108,RICHIER Laurent108,EL SANHARAWI Mohamed108,

Affiliation:

1. Department of Infectious and Tropical Diseases, Bichat‐Claude Bernard University Hospital AP‐HP.Nord‐Université de Paris Paris France

2. Université de Paris, INSERM, IAME UMR 1137, Paris, France Paris France

3. ANRS, Paris, France

4. CHU Amiens, France

5. CHU Jean Minjoz, Besançon, France

6. CHU Bordeaux, France

7. CHU Lille, France

8. CHU Nancy, France

9. CHU Rouen, France

10. FCRIN INI‐CRCT, Paris, France

11. F‐CRIN Partners Platform, Paris, France

12. Hôpital Européen Georges Pompidou, Paris, France

13. Hôpital Bichat, Paris, France

14. hôpital la timone, Marseille, France

15. Hôpital Louis Mourier, Colombes, France

16. Hôpital Necker, Paris, France

17. Hôpital Robert Debré, Paris, France

18. Inserm CIC‐1414, Rennes, France

19. Inserm sponsor, Paris, France

20. Inserm UMR 1018, Paris, France

21. Inserm UMR 1111, Lyon, France

22. Inserm UMR 1136, Paris, France

23. Inserm UMR 1137, Paris, France

24. Inserm UMR 1163, Paris, France

25. Inserm UMR 1219, Bordeaux, France

26. Inserm UMR 955, Créteil, France

27. Pasteur Institute, Paris, France

28. REACTing, Paris, France

29. RENARCI, Annecy, France

30. CHG d'Agen

31. CH du Pays d'Aix, Aix en Provence

32. CHU Amiens Nord

33. CHU d'Angers

34. CH d'Annecy Genevois

35. Hôpital privé d'Antony

36. CH Henri Duffaut, Avignon

37. Hôpital d'instruction des armées Begin

38. CHU Jean Minjoz, Besançon

39. CH de Béziers

40. Hôpital Avicenne, Bobigny

41. CHU Pellegrin, Bordeaux

42. CHU Ambroise Paré, Boulogne Billancourt

43. CH Fleyriat, Bourg en Bresse

44. CH Pierre Oudot, Bourgoin‐Jallieu

45. CHRU de Brest

46. CH de Cahors

47. CH Andrée Rosemon, Cayenne

48. CHMS Chambéry NH

49. CH de Cholet

50. CHU Gabriel Montpied, Clermont‐Ferrand

51. Hôpital Pasteur, Colmar

52. Hôpital Louis Mourier, Colombes

53. CH Alpes Leman Contamine sur Arve

54. Centre Hospitalier Intercommunal de Créteil

55. CH de Dax

56. CHU de Dijon Bourgogne

57. CHU de Martinique, Fort de France

58. Hôpital Raymond Poincaré, Garches

59. CHU de Grenoble

60. Grand Hôpital de l'Est Francilien site Marne‐la‐Vallée, Jossigny

61. CHD Les Oudairies, La Roche Sur Yon

62. Hôpital Universitaire Bicêtre, Le Kremlin‐Bicêtre

63. CH Emile Roux, Le Puy en Velay

64. CHRU de Lille, Hôpital Salengro

65. CHRU de Lille, Hôpital Fourrier

66. CHRU de Lille, Hôpital Albert Calmette

67. Hôpital de la Croix Rousse, Lyon

68. Hôpital Louis Raffalli, Manosque

69. Hôpital Européen de Marseille

70. Hôpital Conception, Marseille

71. Groupe Hospitalier Sud Ile De France, hôpital de Melun

72. Hôpital de Mercy, CHR Metz‐Thionville, Ars laquenexy

73. CH de Mont Marsan

74. CHU de Montpellier

75. CHU de Nantes

76. Hôpital Américain de Paris, Neuilly sur Seine

77. CHU de Nice

78. CHU Caremeau, Nîmes

79. Hôpital Bichat, Paris

80. Hôpital Cochin, Paris

81. Groupe Hospitalier Diaconesses Croix Saint‐Simon, Paris

82. Hôpital Européen Georges Pompidou, Paris

83. Hôpital Lariboisière, Paris

84. Hôpital Saint Antoine, Paris

85. Hôpital Saint Louis, Paris

86. Hôpital Tenon, Paris

87. CH de Pau

88. CH de Périgueux

89. CH de Perpignan

90. CHU de Pointe à Pitre, Guadeloupe

91. CHU de Poitiers

92. CH Quimper

93. CHU Reims

94. CHU Rennes

95. CHU Rouen

96. CH Saint Denis et Saint Pierre, La réunion

97. CH Saintes

98. CH Soisson

99. Hôpital Foch, Suresnes

100. Hôpital Bel Air, Thionville

101. CH Thonon les Bains

102. CHU de Toulouse

103. CH Tourcoing

104. CHU Bretonneau, Tours

105. CH Vannes

106. CHU de St Etienne

107. CHU de Nancy, Vandoeuvre les Nancy

108. CH Villeneuve St Georges

Publisher

Wiley

Subject

Infectious Diseases,Virology

Reference15 articles.

1. A Novel Coronavirus from Patients with Pneumonia in China, 2019

2. Clinical and virological data of the first cases of COVID-19 in Europe: a case series

3. WHO.Coronavirus disease (COVID‐19) technical guidance: laboratory testing for 2019‐nCoV in humans.https://www.who.int/emergencies/diseases/novel-coronavirus-2019/technical-guidance/laboratory-guidance. Accessed April 30 2020.

4. Institut Pasteur Paris.Protocol: real‐time RT‐PCR assays for the detection of SARS‐CoV‐2.https://www.who.int/docs/default-source/coronaviruse/real-time-rt-pcr-assays-for-the-detection-of-sars-cov-2-institut-pasteur-paris.pdf?sfvrsn=3662fcb6_2. Accessed April 24 2020.

5. Detection of 2019 novel coronavirus (2019-nCoV) by real-time RT-PCR

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