Maschinelles Lernen zur Vorhersage antibakterieller Aktivität von Ruthenium‐Komplexen**

Author:

Orsi Markus1ORCID,Shing Loh Boon2,Weng Cheng2ORCID,Ang Wee Han23ORCID,Frei Angelo1ORCID

Affiliation:

1. Department für Chemie Biochemie & Pharmazie Universität Bern Freiestrasse 3 3012 Bern Schweiz

2. Department of Chemistry National University of Singapore 3 Science Drive 3 Singapore 117543 Singapur

3. NUS Graduate School - Integrated Science and Engineering Programme (ISEP) National University of Singapore 21 Lower Kent Ridge Rd Singapore 119077 Singapur

Abstract

AbstractDie steigende antimikrobielle Resistenz (AMR) und der Mangel an Innovation in der Antibiotikaforschung erfordern neue Ansätze zur Entwicklung von Medikamenten. Metallkomplexe haben sich als vielversprechende antimikrobielle Verbindungen erwiesen. Allerdings ist die Anzahl der untersuchten Verbindungen noch klein, besonders im Vergleich zu den Millionen organischer Moleküle die bereits getestet wurden. In den letzten Jahren hat sich maschinelles Lernen (ML) als wertvolle Ressource für die Entwicklung organischer Moleküle herauskristallisiert, selbst wenn nur wenige Daten vorliegen. Erstmals erweitern wir die Anwendung von ML auf die Entdeckung von metallbasierten antimikrobiellen Verbindungen. Mithilfe von 288 modular synthetisierten Ruthenium‐Aren‐Schiff‐Basen‐Komplexen und deren antibakteriellen Eigenschaften haben wir eine Reihe von ML–Modellen trainiert. Die Modelle zeigen gute Leistungen und werden verwendet, um die Aktivität von 54 neuen Verbindungen vorherzusagen. Diese Verbindungen weisen eine 5.7‐fach höhere Trefferquote (53.7 %) gegen Methicillin‐resistente Staphylococcus aureus (MRSA) im Vergleich zur ursprünglichen Bibliothek (9.4 %) auf. Dadurch zeigen wir, dass ML zu höheren Erfolgsraten bei der Suche nach neuen Metalloantibiotika führen kann. Folglich ebnet diese Arbeit den Weg für fortschrittlichere Anwendungen von ML im Bereich der metallbasierten Wirkstoffentwicklung.

Funder

Schweizerischer Nationalfonds zur Förderung der Wissenschaftlichen Forschung

Wellcome Trust

H2020 European Research Council

Publisher

Wiley

Subject

General Medicine

Reference37 articles.

1. Global burden of bacterial antimicrobial resistance in 2019: a systematic analysis

2. Antimicrobial Use in COVID-19 Patients in the First Phase of the SARS-CoV-2 Pandemic: A Scoping Review

3. CDC “COVID-19 & Antibiotic Resistance ” can be found underhttps://www.cdc.gov/drugresistance/covid19.html 2022.

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5. Antibiotics in the clinical pipeline as of December 2022

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