Performance evaluation of GPU parallelization, space-time adaptive algorithms, and their combination for simulating cardiac electrophysiology

Author:

Sachetto Oliveira Rafael1ORCID,Martins Rocha Bernardo2ORCID,Burgarelli Denise3,Meira Wagner4,Constantinides Christakis5,Weber dos Santos Rodrigo2

Affiliation:

1. Departamento de Ciência da Computação; Universidade Federal de São João de Rei; São João del-rei MG Brazil

2. Departamento de Ciência da Computação e Programa em Modelagem Computacional; Universidade Federal de Juiz de Fora; Juiz de Fora, MG Brazil

3. Departamento de Matemática; Universidade Federal de Minas Gerais; Belo Horizonte, MG Brazil

4. Departamento de Ciência da Computação; Universidade Federal de Minas Gerais; Belo Horizonte, MG Brazil

5. Department of Cardiovascular Medicine; U. Oxford, Oxford UK

Funder

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais

Universidade Federal de Juiz de Fora

Universidade Federal de São João del-rei (UFSJ)

Financiadora de Estudos e Projetos

Publisher

Wiley

Subject

Applied Mathematics,Computational Theory and Mathematics,Molecular Biology,Modeling and Simulation,Biomedical Engineering,Software

Reference47 articles.

1. Low energy defibrillation in human cardiac tissue: a simulation study;Morgan;Biophys J,2009

2. Elimination of spiral waves in cardiac tissue by multiple electrical shocks;Panfilov;Phys Rev E,2000

3. Re-entrant activity and its control in a model of mammalian ventricular tissue;Biktashev;Proc R Soc B,1996

4. A comparison of non-standard solvers for odes describing cellular reactions in the heart;MacLachlan;Comput Methods Biomech Biomed Engin,2007

5. Simulations of complex and microscopic models of cardiac electrophysiology powered by multi-gpu platforms;Gouvêa de Barros;Comput Math Methods Med,2012

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