Variance component analysis to assess protein quantification in biomarker discovery. Application to MALDI-TOF mass spectrometry

Author:

Mercier Catherine12345ORCID,Klich Amna12345,Truntzer Caroline6,Picaud Vincent78,Giovannelli Jean-François91011,Ducoroy Patrick6,Grangeat Pierre1213,Maucort-Boulch Delphine12345,Roy Pascal12345

Affiliation:

1. Service de Biostatistique-Bioinformatique; Hospices Civils de Lyon; Lyon France

2. Université de Lyon; Lyon France

3. Département Biostatistiques et Modélisation pour la santé et l'environnement; Université Lyon 1; Villeurbanne 69622 France

4. Pôle Rhône-Alpes de Bioinformatique (PRABI); Villeurbanne France

5. CNRS UMR 5558; Laboratoire de Biométrie et Biologie Évolutive (LBBE); Équipe Biostatistique Santé; Villeurbanne France

6. Clinical and Innovation Proteomic Platform (CLIPP); Pôle de Recherche Université de Bourgogne; Dijon France

7. Commissariat à l’Énergie Atomique et aux Énergies Alternatives; Gif-sur-Yvette France

8. Université Paris-Saclay; Saint-Aubin France

9. CNRS UMR 5218; Laboratoire de l'Intégration du Matériau au Système (IMS); Talence France

10. Département micro Technologies pour la biologie et la santé; Université de Bordeaux; Talence France

11. Institut Polytechnique de Bordeaux (Bordeaux INP); Talence France

12. Innovation en micro et nanotechnologie; Université de Grenoble-Alpes; Grenoble France

13. Commissariat à l’Énergie Atomique et aux Énergies Alternatives; Laboratoire d’Électronique et de Technologie de l'Information; MINATEC Campus; Grenoble France

Funder

Agence Nationale pour la Recherche

Hospices Civils de Lyon

Publisher

Wiley

Subject

Statistics, Probability and Uncertainty,General Medicine,Statistics and Probability

Reference31 articles.

1. Peaks detection and alignment for mass spectrometry data;Antoniadis;Journal de la Société Française de Statistique,2010

2. Are there two regressions?;Berkson;Journal of the American Statistical Association,1950

3. Statistical issues in quality control of proteomic analyses: Good experimental design and planning;Cairns;Proteomics,2011

4. Targeted peptide measurement in biology and medicine: Best practices for mass spectrometry-based assay development using a fit-for-purpose approach;Carr;Molecular and Cellular Proteomics,2014

5. Measurement Error in Nonlinear Models

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