Discrimination of Escherichia coli, Shigella flexneri , and Shigella sonnei using lipid profiling by MALDI‐TOF mass spectrometry paired with machine learning

Author:

Pizzato Jade1,Tang Wenhao2,Bernabeu Sandrine345,Bonnin Rémy A.45,Bille Emmanuelle6,Farfour Eric7,Guillard Thomas8,Barraud Olivier9,Cattoir Vincent10,Plouzeau Chloe11,Corvec Stéphane12,Shahrezaei Vahid2,Dortet Laurent345,Larrouy‐Maumus Gerald1ORCID

Affiliation:

1. Faculty of Natural Sciences, Department of Life Sciences, MRC Centre for Molecular Bacteriology & Infection Imperial College London England

2. Faculty of Natural Sciences, Department of Mathematics Imperial College London England

3. CHU de Bicêtre, Laboratoire de Bactériologie‐Hygiène Assistance Publique des Hôpitaux de Paris Le Kremlin‐Bicêtre France

4. INSERM UMR 1184, Team RESIST, Faculté de Médecine Université Paris‐Saclay Le Kremlin‐Bicêtre France

5. Centre National de Référence de la Résistance aux Antibiotiques Le Kremlin‐Bicêtre France

6. Service de Microbiologie, Assistance Publique‐Hôpitaux de Paris, Hôpital Necker Enfants‐Malades AP‐HP Centre‐Université de Paris Paris France

7. Service de Biologie Clinique Hôpital Foch Suresnes France

8. Université de Reims‐Champagne‐Ardenne, Inserm UMR‐S 1250 P3Cell, SFR CAP‐Santé, Laboratoire de Bactériologie‐Virologie‐Hygiène, Hospitalière‐Parasitologie‐Mycologie, Hôpital Robert Debré CHU Reims Reims France

9. CHU Limoges, Service de Bactériologie‐Virologie‐Hygiène, CIC1435, INSERM 1092 Université de Limoges, UMR Limoges France

10. Service de Bactériologie‐Hygiène CHU de Rennes Rennes France

11. Service de Bactériologie et d'Hygiène hospitalière, Unité de microbiologie moléculaire et séquençage CHU de Poitiers Poitiers France

12. Université de Nantes, CHU Nantes, Service de Bactériologie et des Contrôles Microbiologiques, INSERM, INCIT UMR 1302 F‐ 44000 Nantes France

Funder

Medical Research Council

Publisher

Wiley

Subject

Microbiology

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