Possible incomplete penetrance of Xq28 int22h‐1/int22h‐2 duplication

Author:

Billes Alexis12,Pujalte Mathilde3,Jedraszak Guillaume24,Amsallem Daniel5,Boudry‐Labis Elise6,Boute Odile7,Bouquillon Sonia6,Brischoux‐Boucher Elise8ORCID,Callier Patrick91011,Coutton Charles1213ORCID,Denizet Anne‐Laude Avice8,Dieterich Klaus1415,Kuentz Paul1617,Lespinasse James18,Mazel Benoît19,Morin Gilles1,Amram Florence1,Pennamen Perrine20,Rio Marlène2122,Piard Juliette823ORCID,Putoux Audrey2425,Rama Mélanie6,Roze‐Guillaumey Virginie16,Schluth‐Bolard Caroline32627ORCID,Till Marianne3,Trouvé Chloé8,Vieville Gaëlle28,Rooryck Caroline2930ORCID,Sanlaville Damien326,Chatron Nicolas326ORCID

Affiliation:

1. CHU Amiens Picardie Service de Génétique Clinique Amiens France

2. CHU Amiens Picardie, Laboratoire de Génétique Constitutionnelle Amiens France

3. Service de Génétique Groupement Hospitalier Est, Hospices Civils de Lyon Bron France

4. CHU Amiens Picardie, Département de génétique, UR4666 HEMATIM, CURS Université Picardie Jules Verne Amiens France

5. Service de Neuropédiatrie, CHU de Besançon Besançon France

6. Institut de Génétique Médicale, Hôpital Jeanne de Flandre, Centre Hospitalier Universitaire de Lille Lille France

7. Génétique Clinique Centre Hospitalier Universitaire de Lille, Hôpital Jeanne de Flandre Lille France

8. Centre de Génétique Humaine ‐ CHU de Besançon Université de Bourgogne‐Franche‐Comté Besançon France

9. Inserm UMR 1231 GAD Génétique des Anomalies du Développement Université de Bourgogne Dijon France

10. Unité Fonctionnelle Innovation diagnostique dans les maladies rares, laboratoire de génétique chromosomique et moléculaire, Plateau Technique de Biologie, CHU Dijon Bourgogne Dijon France

11. Fédération Hospitalo‐Universitaire Médecine Translationnelle et Anomalies du Développement (FHU TRANSLAD) CHU Dijon Bourgogne et Université de Bourgogne‐Franche Comté Dijon France

12. Service de Génétique, Génomique, et Procréation Centre Hospitalier Universitaire Grenoble Alpes La Tronche France

13. INSERM 1209, CNRS UMR 5309, Institut pour l'Avancée des Biosciences (IAB) Université Grenoble Alpes Grenoble France

14. Université Grenoble Alpes, Inserm, U1216, CHU Grenoble Alpes, Medical Genetics Grenoble Institute of Neurosciences Grenoble France

15. CHU Grenoble, UM Génétique Chromosomique Grenoble France

16. Oncobiologie Génétique Bioinformatique, PCBio, CHU de Besançon Besançon France

17. UFR Des Sciences de Santé, INSERM‐Université de Bourgogne UMR1231 GAD “Génétique des Anomalies du Développement”, FHUTRANSLAD Dijon France

18. Centre Hospitalier de Chambéry Service de Cytogénétique Chambéry France

19. Centre de Génétique et Centre de Référence Anomalies du Développement et Syndromes Malformatifs, FHUTRANSLAD ‐ CHU Dijon Bourgogne Dijon France

20. CHU Bordeaux Laboratoire de Génétique Biologique Bordeaux France

21. Université Paris Cité, Institut Imagine, Inserm U1163 Paris France

22. Service de Médecine Génomique des maladies rares AP‐HP, Centre Hôpital Necker‐Enfants Malades Paris France

23. UMR 1231 GAD, Inserm Université de Bourgogne Franche Comté Dijon France

24. Hospices Civils de Lyon Service de Génétique, Groupement Hospitalier Est Bron France

25. Equipe GENDEV, Centre de Recherche en Neurosciences de Lyon, INSERM U1028 CNRS UMR5292, Université Claude Bernard Lyon 1 Lyon France

26. Institute NeuroMyoGène, Laboratoire Physiopathologie et Génétique du Neurone et du Muscle, CNRS UMR 5261‐INSERM U1315 Université de Lyon ‐ Université Claude Bernard Lyon 1 Lyon France

27. Laboratoire de Diagnostic Génétique, Institut de Génétique Médicale d'Alsace, Hôpitaux Universitaires de Strasbourg Strasbourg France

28. Département de Génétique et Procréation, Hôpital Couple Enfant, CHU Grenoble‐Alpes Grenoble France

29. CHU de Bordeaux Service de Génétique Médicale Bordeaux France

30. Univ. Bordeaux Maladies Rares: Génétique et Métabolisme (MRGM), U 1211 INSERM Bordeaux France

Abstract

AbstractXq28 int22h‐1/int22h‐2 duplication is the result of non‐allelic homologous recombination between int22h‐1/int22h‐2 repeats separated by 0.5 Mb. It is responsible for a syndromic form of intellectual disability (ID), with recurrent infections and atopic diseases. Minor defects, nonspecific facial dysmorphic features, and overweight have also been described. Half of female carriers have been reported with ID, whereas all reported evaluated born males present mild to moderate ID, suggesting complete penetrance. We collected data on 15 families from eight university hospitals. Among them, 40 patients, 21 females (one fetus), and 19 males (two fetuses), were carriers of typical or atypical Xq28 int22h‐1/int22h‐2 duplication. Twenty‐one individuals were considered asymptomatic (16 females and 5 males), without significantly higher rate of recurrent infections, atopia, overweight, or facial dysmorphism. Approximately 67% live‐born males and 23% live‐born female carriers of the typical duplication did not have obvious signs of intellectual disability, suggesting previously undescribed incomplete penetrance or low expression in certain carriers. The possibility of a second‐hit or modifying factors to this possible susceptibility locus is yet to be studied but a possible observational bias should be considered in assessing such challenging X‐chromosome copy number gains. Additional segregation studies should help to quantify this newly described incomplete penetrance.

Publisher

Wiley

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