Colpodean ciliate phylogeny and reference alignments for phylogenetic placements

Author:

Rajter ĽubomírORCID,Ewers IsabelleORCID,Graupner NadineORCID,Vďačný PeterORCID,Dunthorn Micah

Funder

Agentúra na Podporu Výskumu a Vývoja

Vedecká Grantová Agentúra MŠVVaŠ SR a SAV

Deutsche Forschungsgemeinschaft

Publisher

Elsevier BV

Subject

Microbiology

Reference47 articles.

1. Revisions to the classification, nomenclature, and diversity of eukaryotes;Adl;J. Eukaryot. Microbiol.,2019

2. Bayes or bootstrap? A simulation study comparing the performance of Bayesian Markov Chain Monte Carlo sampling and boostrapping in assessing phylogenetic confidence;Alfaro;Mol. Biol. Evol.,2003

3. Basic local alignment search tool;Altschul;J. Mol. Biol.,1990

4. SCRAPP: A tool to assess the diversity of microbial samples from phylogenetic placements;Barbera;Mol. Ecol. Resour.,2020

5. EPA-ng: massively parallel evolutionary placement of genetic sequences;Barbera;Syst. Biol.,2019

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