Efficient pattern matching in degenerate strings with the Burrows–Wheeler transform

Author:

Daykin J.W.,Groult R.,Guesnet Y.,Lecroq T.,Lefebvre A.,Léonard M.,Mouchard L.,Prieur-Gaston É.,Watson B.

Funder

European Regional Development Fund through the Welsh Government

Publisher

Elsevier BV

Subject

Computer Science Applications,Information Systems,Signal Processing,Theoretical Computer Science

Reference12 articles.

1. A Block Sorting Lossless Data Compression Algorithm;Burrows,1994

2. Handbook of Exact String Matching Algorithms;Charras,2004

3. Linear algorithm for conservative degenerate pattern matching;Crochemore;Eng. Appl. Artif. Intell.,2016

4. Indeterminate string factorizations and degenerate text transformations;Daykin;Math. Comput. Sci.,2017

5. String matching and other products;Fischer,1974

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