Efficient pattern matching for RNA secondary structures

Author:

Beal Richard,Adjeroh Donald

Funder

National Science Foundation

Publisher

Elsevier BV

Subject

General Computer Science,Theoretical Computer Science

Reference43 articles.

1. The Burrows–Wheeler Transform: Data Compression, Suffix Arrays and Pattern Matching;Adjeroh,2008

2. Suffix sorting via Shannon–Fano–Elias codes;Adjeroh;Algorithms,2010

3. A new distance for high level RNA secondary structure comparison;Allali;EEE/ACM Trans. Comput. Biol. Bioinform.,2005

4. Alphabet dependence in parameterized matching;Amir;Inform. Process. Lett.,1994

5. Fast detection of common sequence structure patterns in RNAs;Backofen;J. Discrete Algorithms,2007

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