Identification of haploblocks potentially associated with embryonic mortality in Black-and-White cattle

Author:

Shevkunov Oleg1ORCID,Kostyunina O.23,Bykova Ol'ga3,Zyryanova A3

Affiliation:

1. Ural State Agrarian University

2. All-Russian Institute of animal husbandry named after L. K. Ernst

3. Ural'skiy gosudarstvennyy agrarnyy universitet

Abstract

Abstract. In modern realities, the problem of cattle reproduction is becoming one of the most important issues in managing a large herd. The long-term desire of breeders in all countries of the world to increase milk productivity in dairy cattle has led to the degradation of their reproductive capacity. The service period has increased by more than 40 days, the insemination index has increased almost 2 times, the intercalving period has become 3 months longer than a year. Due to intensive selection aimed at milk production and a decrease in reproductive capacity, a cow does not give birth to a calf every year, and the percentage of pregnant animals after the first insemination has sharply decreased to 30%. In terms of the degree of loss of reproductive function in cows, embryonic mortality ranks first, due to which up to 70% of pregnancy losses occur in the first 45 days after fruitful insemination. Accelerating the pace of breeding progress requires the use of genomic selection in animal husbandry, which will make it possible to conduct genome-wide association studies (GWAS) with indicators of productive longevity and fertility of cows and to identify genomic regions subject to the greatest selection pressure for indicators of productive longevity and reproductive function of dairy cattle. Purpose of the work: Identification of haplotypes responsible for reproductive function of cattle. Research methods. The studies were conducted on the Holstein breed of cattle. Identification of homozygous haplotypes was carried out using the GHap package in R software. The scientific novelty of the work lies in the identification of homozygous haplotypes responsible for early embryonic mortality and affecting fertility in a population of Holstein cows of the Ural type, Results. During the processing of the data obtained, chromosomes with haploblocks were identified, which may be responsible for early embryonic mortality and affecting the fertility of cattle.

Publisher

Urals State Agrarian University

Reference23 articles.

1. Гетманцева Л. В., Шевцова В. С., Колосова М. А., Романенкова О. С., Костюнина О. В. Исследование гаплотипов фертильности у голштинских коров голландского происхождения в условиях ростовской области // Главный зоотехник. 2020. № 4. С. 36–40. DOI: 10.33920/sel-03-2004-05., Getmanceva L. V., Shevcova V. S., Kolosova M. A., Romanenkova O. S., Kostyunina O. V. Issledovanie gaplotipov fertil'nosti u golshtinskih korov gollandskogo proishozhdeniya v usloviyah rostovskoy oblasti // Glavnyy zootehnik. 2020. № 4. S. 36–40. DOI: 10.33920/sel-03-2004-05.

2. Форнара М. С., Костюнина О. В., Филипченко А. А., Сермягин А. А., Зиновьева Н. А. Система определения полиморфизма SUGT1, ассоциированного с гаплотипом фертильности симментальского скота FH4 // Ветеринария, зоотехния и биотехнология. 2019. № 3. С. 92–97. DOI: 10.26155/vet.zoo.bio.201903015., Fornara M. S., Kostyunina O. V., Filipchenko A. A., Sermyagin A. A., Zinov'eva N. A. Sistema opredeleniya polimorfizma SUGT1, associirovannogo s gaplotipom fertil'nosti simmental'skogo skota FH4 // Veterinariya, zootehniya i biotehnologiya. 2019. № 3. S. 92–97. DOI: 10.26155/vet.zoo.bio.201903015.

3. Исупова Ю. В., Ачкасова Е В. Перспективы использования оценки геномной племенной ценности в селекции молочного скота в условиях Удмуртской Республики // Известия Оренбургского государственного аграрного университета. 2021. № 4 (90). С. 307–311., Isupova Yu. V., Achkasova E V. Perspektivy ispol'zovaniya ocenki genomnoy plemennoy cennosti v selekcii molochnogo skota v usloviyah Udmurtskoy Respubliki // Izvestiya Orenburgskogo gosudarstvennogo agrarnogo universiteta. 2021. № 4 (90). S. 307–311.

4. Нарышкина Е. Н., Сермягин А. А. Оценка генетической и геномной вариабельности признаков фертильности быков-производителей на основе локусов в геноме, ассоциированных с давлением отбора (обзор) // Достижения науки и техники АПК. 2020. № 9. С. 64–72. DOI: 10.24411/0235-2451-2020-10912, Naryshkina E. N., Sermyagin A. A. Ocenka geneticheskoy i genomnoy variabel'nosti priznakov fertil'nosti bykov-proizvoditeley na osnove lokusov v genome, associirovannyh s davleniem otbora (obzor) // Dostizheniya nauki i tehniki APK. 2020. № 9. S. 64–72. DOI: 10.24411/0235-2451-2020-10912

5. Романенкова О. С., Волкова В. В., Костюнина О. В., Зиновьева Н. А. Исследование Российской популяции голштинского и голштинизированного черно-пестрого купного рогатого скота на наличие мутации в гене TFB1M, ассоциированного с гаплотипом HH5 // Биотехнология в растениеводстве, животноводстве и сельскохозяйственной микробиологии: сборник тезисов докладов 19-й Всероссийской конференции молодых ученых, посвященной памяти академика РАСХН Георгия Сергеевича Муромцева. Москва, 2019. С. 119–120., Romanenkova O. S., Volkova V. V., Kostyunina O. V., Zinov'eva N. A. Issledovanie Rossiyskoy populyacii golshtinskogo i golshtinizirovannogo cherno-pestrogo kupnogo rogatogo skota na nalichie mutacii v gene TFB1M, associirovannogo s gaplotipom HH5 // Biotehnologiya v rastenievodstve, zhivotnovodstve i sel'skohozyaystvennoy mikrobiologii: sbornik tezisov dokladov 19-y Vserossiyskoy konferencii molodyh uchenyh, posvyaschennoy pamyati akademika RASHN Georgiya Sergeevicha Muromceva. Moskva, 2019. S. 119–120.

同舟云学术

1.学者识别学者识别

2.学术分析学术分析

3.人才评估人才评估

"同舟云学术"是以全球学者为主线,采集、加工和组织学术论文而形成的新型学术文献查询和分析系统,可以对全球学者进行文献检索和人才价值评估。用户可以通过关注某些学科领域的顶尖人物而持续追踪该领域的学科进展和研究前沿。经过近期的数据扩容,当前同舟云学术共收录了国内外主流学术期刊6万余种,收集的期刊论文及会议论文总量共计约1.5亿篇,并以每天添加12000余篇中外论文的速度递增。我们也可以为用户提供个性化、定制化的学者数据。欢迎来电咨询!咨询电话:010-8811{复制后删除}0370

www.globalauthorid.com

TOP

Copyright © 2019-2024 北京同舟云网络信息技术有限公司
京公网安备11010802033243号  京ICP备18003416号-3