FARKLI İLLERDEN TOPLANAN EKŞİ HAMUR ÖRNEKLERİNDEN SACCHAROMYCES CEREVISIAE SUŞLARININ İZOLASYONU, MOLEKÜLER KARAKTERİZASYONU VE POPÜLASYON ANALİZLERİ
Author:
KOÇAK Nilgün1ORCID, ARDIÇ Mustafa2ORCID
Affiliation:
1. Aksaray İl Tarım ve Orman Müdürlüğü 2. AKSARAY ÜNİVERSİTESİ, MÜHENDİSLİK FAKÜLTESİ, GIDA MÜHENDİSLİĞİ BÖLÜMÜ, GIDA MÜHENDİSLİĞİ PR.
Abstract
Bu çalışmada 3 farklı ilden (Aksaray, Niğde ve Konya) toplanan 18 adet geleneksel ekşi hamur örneğinden Saccharomyces cerevisiae suşlarının izolasyonu, farklı DNA markörleri ile genotipik karakterizasyonu ve popülasyon analizlerinin gerçekleştirilmesi amaçlanmıştır. İzole edilen 72 adet endojen mayanın 58 tanesi S. cerevisiae olarak tanımlanmıştır. Tür içi genetik varyasyonun belirlenmesinde SCoT 13 primeri, iPBS ve ISSR primerlerine göre daha faydalı sonuçlar vermiştir. Popülasyonlar arasındaki mesafe arttıkça genetik uzaklık dereceleri de artış göstermiştir (R=0.74). Popülasyonlar arası (%16) ve popülasyonlar içindeki (%84) genetik varyasyon dereceleri istatistiki olarak önemli bulunmuştur (P < 0.001). UPGMA dendrogramı üzerinde suşlar birçok alt gruba ayrılmış olup STRUCTURE analizine göre anlamlı alt grup sayısı iki çıkmıştır (ΔK=2). UPGMA ve PCoA'ya göre kümelenme suşların izole edildiği bölgelere göre gerçekleşmemiş olup rastgele dağılım gözlemlenmiştir.
Publisher
Association of Food Technology, Turkey
Reference49 articles.
1. Arıcı, M., Özülkü, G., Yıldırım, R. M., Sağdıç, O., Durak, M. Z. (2018). Biodiversity and technological properties of yeasts from Turkish sourdough. Food science and biotechnology, 27, 499-508. doi:10.1007/s10068-017-0282-0. 2. Arora, K., Ameur, H., Polo, A., Di Cagno, R., Rizzello, C. G., Gobbetti, M. (2021). Thirty years of knowledge on sourdough fermentation: A systematic review. Trends in Food Science & Technology, 108, 71-83, doi: 10.1016/ j.tifs.2020.12.008 3. Aydın, F., Özer, G., Alkan, M., Çakır, İ. (2020). The utility of iPBS retrotransposons markers to analyze genetic variation in yeast. International Journal of Food Microbiology, 325, 108647, doi: 10.1016/j.ijfoodmicro.2020.108647 4. Aydın, F., Özer, G., Alkan, M., Çakır, İ. (2022a). Start Codon Targeted (SCoT) markers for the assessment of genetic diversity in yeast isolated from Turkish sourdough. Food Microbiology, 107, 104081, doi: 10.1016/j.fm.2022.104081 5. Aydın, F., Özer, G., Alkan, M., Çakır, İ. (2022b). Genetic diversity and population structure of Saccharomyces cerevisiae isolated from Turkish sourdough by iPBS-retrotransposons markers. Archives of Microbiology, 204(12), 693, doi: 10.1007/s00203-022-03313-x
|
|