ДОСЛІДЖЕННЯ КОМПОНЕНТІВ ЕФІРНИХ ОЛІЙ ЯК ПОТЕНЦІЙНИХ ДЕЗІНФІКУЮЧИХ ЗАСОБІВ ІНГІБІТОРІВ СПАЙК ГЛІКОПРОТЕЇНУ SARS-COV-2

Abstract

У цій роботі ми поєднали дві мети: створення шаблону для побудови гомологічних моделей рецептор-зв'язуючого домену спайк глікопротеїнів різних варіантів SARS-CoV-2 та його практичне застосування для сканування природних сполук як потенційних дезінфікуючих засобів. Дев'ять варіантів SARS-CoV-2: Дикий тип, Альфа, Бета, Гамма, Дельта, Епсилон, Лямбда, Мю та Омікрон – стали об'єктом цього дослідження. Розглянуто природу взаємодії між білком ACE2 та рецептор-зв'язуючим доменом з метою виявлення критичних для зв'язування амінокислот. В якості прикладу, ряд активних інгредієнтів, які часто зустрічаються в традиційних китайських лікарських засобах, були оцінені за допомогою обчислень на предмет їхньої інгібуючої активності. Результати, отримані в цьому дослідженні, свідчать про те, що метод гомологічного моделювання, випробуваний тут, може бути успішно використаний, коли 3D-структури ще недоступні. Розроблений підхід може бути використаний для моделювання мутантів, кристалічна структура яких ще не відома, та сканування більш широкої бібліотеки сполук проти інших мутованих вірусних білків.