Determination of antagonistic effects antagonist bacterial isolates obtained from composts against melon wilt disease agent Fusarium oxysporum f.sp. melonis in vitro conditions

Abstract

Amaç: Bu çalışmada zeytin, pamuk ve hayvansal atıklardan yapılmış 5 farklı komposttan antagonistik etkinliğe sahip bakterilerin izolasyonu, tanılanması ve kavun solgunluk hastalığı etmeni Fusarium oxysporum f. sp. melonis (Fom)’in misel gelişimini engellemeleri üzerine olan etkinlikleri in vitro koşullarda araştırılmıştır.Yöntem ve Bulgular: Kompostların fermentasyon süresine bağlı olarak bakteriyel popülasyon sayısında artış görülmüştür. En yüksek bakteri popülasyonu fermentasyonun 3 ve 4. aylarında belirlenmiştir. Farklı kompost materyallerinden izole edilen antagonist adayı bakteri izolatları Yağ Asit-Metil Ester (FAME) profillerine göre Mikrobiyal Tanılama Sistemi (MIS) ile teşhis edilmiştir. Aday bakterilerin Fom’in misel gelişimini engelleme potansiyelleri ikili kültür testleri ile belirlenmiştir. Elde edilen aday bakteriyel izolatlar arasında 31 bakteri izolatı ikili kültür denemelerinde, Fom’in misel gelişimini engellenmesi üzerine değişik oranlarda antagonistik etkinlik göstermiştir. Antagonistik potansiyele sahip bakteri izolatlarının çoğunluğunu farklı Bacillus spp.’a ait izolatlar (% 73.3) oluşturmuştur. Farklı kompost materyallerinden izole edilen bakteriler arasında en yüksek antagonistik etki %48.33 engelleme oranı ile Entereobacter gergoviae K4B:4:7:1 izolatı tarafından gösterilmiş olup, bu izolatı sırasıyla Bacillus cereus K1B:4:8:1 (%47.5), Salmonella typhimurium K5B:1:4:3 (% 46.67), Bacillus amyloliquefaciens K5B:0:5:1 (%43.33) ve Bacillus subtilis K3B:4:8:1 (%40.83) izolatları izlemiştir.Genel Yorum: Organik atıklardan hazırlanmış kompostlar toprak kökenli hastalıklara karşı etkin antagonistik etkiye sahip bakterilere konukçuluk etmektedir. Kompostların in vivo koşullarda Fom’e karşı kullanılma potansiyellerinin araştırılmasının yanı sıra buralardan biyolojik preparat olarak kullanıma en uygun olan bakteri izolatların seçimi ve hastalığı engellemede kullandıkları mekanizmaların belirlenmesi üzerine çalışmalar gelecekte sürdürülmelidir.Çalışmanın Önemi ve Etkisi: Elde edilen sonuçlar, Fom’in biyolojik mücadelesinde antagonistik potansiyele sahip mikroorganizmaların yoğun olarak geliştiği kompostların seralar gibi sınırlı alana sahip yetiştirme alanlarında kullanılmasının etkin bir rol oynayabileceğini göstermiştir.