1. Centro Nacional de Biotecnología, Consejo Superior de Investigaciones Cientificas, Madrid 28049, Spain
2. Fundación para el Fomento de la Investigación Sanitaria y Biomédica de la Comunitat Valenciana, Valencia 46020, Spain
3. Centro de Ciencias Genómicas, Universidad Nacional Autónoma de México, Cuernavaca 62209, México
4. Instituto de Investigaciones en Matemáticas Aplicadas y en Sistemas, Unidad Académica Yucatán, Universidad Nacional Autónoma de México, Yucatán 04510, México
5. Servicio de Microbiología, Hospital Universitario Ramón y Cajal-Instituto Ramon y Cajal de Investigacion Sanitaria, Madrid 28034, Spain
6. Centro de Investigación Biológica en Red de Enfermedades Infecciosas, Instituto de Salud Carlos III, Madrid 28029, Spain
7. Institut Pasteur, Université de Paris Cité, CNRS UMR3525, Microbial Evolutionary Genomics, Paris 75015, France
8. Centro de Investigación Biológica en Red de Epidemiología y Salud Pública, Instituto de Salud Carlos III, Madrid 28029, Spain