MODELOS DE INTERACCIONES ATÓMICAS EN MECÁNICA MOLECULAR

Abstract

Esta revisión describe modelos de interacciones atómicas utilizados en la mecánica molecular, enfatizando consideraciones que se deben tener en cuenta para su implementación computacional. Estos modelos constituyen los términos de una función que aproxima la superficie de energía potencial de un sistema molecular, conocida como campo de fuerzas. Existen dos grupos de interacciones: enlazantes y no enlazantes. La primera categoría contempla potenciales estiramiento de enlace, flexión de enlaces, torsión de enlace y flexión respecto a un plano molecular. La segunda categoría contempla potenciales electrostáticos y de van der Waals. Las interacciones electrostáticas son descritas mediante la ley de Coulomb, requiriendo una metodología de asignación de cargas. Las interacciones de van der Waals son modeladas mediante términos de largo alcance asociados a la interacción entre dipolos inducidos, y mediante términos de corto alcance asociados a la improbabilidad de encontrar electrones con el mismo espín en el mismo lugar del espacio.