Molekularpathologische Untersuchungen im Wandel der Zeit

Abstract

Zusammenfassung Hintergrund Molekularpathologische Untersuchungen von Tumorproben umfassen ein weites Spektrum an diagnostischen Analysen. Besonders in den letzten Jahren rückten eine Vielzahl neuer Biomarker in den Vordergrund, deren Analyse für Therapieentscheidungen von großer Bedeutung sind. Fragestellung Innerhalb der Molekularpathologie haben die NGS-basierten (Next Generation Sequencing) Anforderungen in den vergangenen Jahren einen massiven Zuwachs erfahren. Um diesen Bedarf abzudecken, werden molekularpathologische Methoden stetig angepasst und weiterentwickelt. Wie dieser Trend zustande kommt und welche Analysen an Bedeutung gewinnen, soll in den folgenden Abschnitten beleuchtet werden. Material und Methode Der Artikel gibt einen Überblick der wesentlichen Techniken Nukleinsäure-basierter Analysen aus dem Bereich der massiven Parallelsequenzierung. Es wird in die Terminologie der DNA- und RNA-basierten Diagnoseverfahren sowie die zugehörigen Analysemethoden eingeführt. Der Fokus liegt hierbei auf deren Einsatz in der molekularpathologischen Routinediagnostik. Ergebnisse Die Breite der genomischen Sequenzierung nimmt in den letzten Jahren stetig zu, was insbesondere dem Ausbau im Bereich der personalisierten Medizin sowie den steigenden Neuzulassungen von zielgerichteten Therapeutika geschuldet ist. Dadurch wird u. a. die Analyse neuer Biomarker erforderlich. Die Diagnostik im Rahmen eines interdisziplinären molekularen Tumorboards (MTB) erfordert mittlerweile den Einsatz von großen Genpanels (> 1 Megabase). Darüber hinaus wurde durch das Modellvorhaben Genomsequenzierung § 64e erstmalig ein Gesetz erlassen, welches für (austherapierte) onkologische Patienten eine Ganzexom- bzw. Ganzgenomsequenzierung vorsieht. In Hinblick auf diese Entwicklungen liegt es nahe, dass zukünftige Analysen die Integration weiterer Omics-Felder wie der Ganztranskriptomanalyse, des Epigenoms sowie des Proteoms erfordern. Schlussfolgerung Die Herausforderungen der personalisierten Medizin sowie die Notwendigkeit des Nachweises einer Vielzahl neuer Biomarker setzen die Implementierung und Umsetzung neuer Techniken in der Molekularpathologie voraus, die eine immer höhere Komplexität aufweisen.