СОВРЕМЕННОЕ СОСТОЯНИЕ АЛЛЕЛОФОНДА ЧЕРНО-ПЕСТРОЙ, ЯРОСЛАВСКОЙ И ХОЛМОГОРСКОЙ ПОРОД СКОТА В ВОЛОГОДСКОЙ ОБЛАСТИ

Abstract

Проведен мониторинг генетического разнообразия пород крупного рогатого скота в Вологодской области для установления степени адмиксии (чистопородности), а также популяционной дифференциации животных черно-пестрой, холмогорской и ярославской пород. С применением методов геномного сканирования (ДНК-микрочипов, имеющих около 150000 SNP) был проведен анализ генотипов 48 племенных коров. Контролем послужили животные голштинской породы. Исследования продуктивных качеств локальных групп скота подтвердили преимущества по удою черно-пестрой и холмогорской пород (70428601 кг). По качественному составу молока лучшими были особи ярославской породы (МДЖ 4,39, МДБ 3,36). Наибольший уровень гетерозиготности (Но) отмечен у холмогорской и черно-пестрой пород 0,394 и 0,392, соответственно. Величина аллельного разнообразия среди локальных популяций была наименьшей для животных ярославской породы (Ar1,957), при этом по коэффициенту инбридинга наблюдался избыток гетерозигот (Fis -0,023), несмотря на невысокий показатель гетерозиготности.Генетические дистанции (FST) между скотом холмогорской, черно-пестрой, ярославской пород и голштинами составляли, соответственно, 0,090, 0,090 и 0,131. Анализ главных компонент показал различия в генетической вариабельности для всех изучаемых пород: по оси PC1 для ярославской и голштинской, PC3 для холмогорской и черно-пестрой, несмотря на умеренную интрогрессию генов трансграничной породы. Исследование чистопородности показало, что все популяции животных имели собственные кластеры. Наименьшая доля голштинских компонентов отмечалась для ярославской, далее черно-пестрой и холмогорской пород. Полученные результаты могут служить научно-практической основой для разработки программ сохранения генофонда пород и их дальнейшего генетического совершенствования.The genetic diversity of cattle breeds in the Vologda region was monitored to determine the degree of admixture (purebred), as well as the population differentiation of Black-and-White, Kholmogor and Yaroslavl breeds. Genotypes of 48 breeding cows were analyzed using genomic scanning methods (DNA microchips having about 150000 SNP). Animals of the Holstein breed were used as control. The characteristic of productive qualities of the studied local groups of cattle confirmed the advantages of Black-and-White and Kholmogor breeds (70428601 kg). The the animals of the Yaroslavl breed were the best in the component composition of milk (massfractionoffat 4,39, massfractionoftotalprotein 3,36). The highest level of heterozygosity (Но) was observed in Kholmogor and Black-and-White breeds-0.394 and 0.392, respectively. The value of allelic diversity among local populations was the lowest for animals of the Yaroslavl breed (Ar1,957), while the inbreeding coefficient showed an excess of heterozygotes (Fis -0.023), despite the low heterozygosity index. Genetic distances (FST) between cattle of Kholmogor, Black-and-White, Yaroslavl breeds and Holsteins were 0,090, 0,090 and 0,131, respectively. The analysis of the main components showed differences in genetic variability for all studied breeds: along the PC1 axis for Yaroslavl and Holstein, PC3 for Kholmogor and Black-and-White, despite moderate introgression of genes of the cross-border breed. The purebred study showed that all animal populations had their own clusters. The smallest proportion of Holstein components was observed for Yaroslavl, then Black-and-White and Kholmogor breeds. The obtained results can serve as a scientific and practical basis for the development of programs for the preservation of the gene pool of breeds and their further genetic improvement.