Analyse de la diversité génétique moléculaire de Haematostaphis barteri (Prune rouge) à l’aide des marqueurs RAPD

Abstract

Haematostaphis barteri est une espèce des savanes de l’Afrique tropicale qui fait objet d’usages multiples et qui joue un rôle socio-économique important pour les populations rurales. C’est une espèce d’Afrique tropicale, allant de la Côte d’Ivoire au Soudan, en passant par le Ghana, le Togo, le Bénin, le Nigéria, le Cameroun et le Tchad. Au Bénin, l’espèce est confinée le long de la chaîne de l’Atacora et fait partie des espèces ligneuses confrontées à un problème de régénération naturelle susceptible d’affecter sa diversité génétique. Dans la présente étude, des marqueurs moléculaires de type RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA) ont été utilisés pour déterminer la structure génétique des populations de Haematostaphis barteri qui existent au Bénin. La diversité génétique révélée à partir de dix amorces est relativement importante (h = 0,250 ; HT = 0,295 ; Hs = 0,245). Par contre le coefficient de différenciation entre sous-populations est faible (FPT = 0,17) ; ce qui signifie que 17% de la diversité totale est inter sous-populations. Le flux de gènes estimé est modéré (Nm = 2,345 migrants par génération) indiquant un échange de graines et de pollens relativement modéré entre les sous-populations. En outre, trois différents groupes génétiques ont été obtenus avec une différenciation bien marquée des accessions du groupe de Boukombé par rapport aux deux autres groupes, indiquant l’existence d’une barrière génétique probablement due à la chaîne de l’Atacora et une limitation des échanges de graines et de pollens avec les autres sous-populations. Les allèles rares mis en évidence au niveau de quelques accessions du groupe génétique de Boukombé pourraient être utilisés, s’ils sont associés à des caractères morphologiques et biochimiques intéressants, dans des programmes de sélection et d’amélioration génétique.