Author:
Rodríguez-Quibrera Cynthia Guadalupe,Almeyda-León Isidro Humberto,Flores de la Rosa Felipe Roberto,Hernández-Mendoza José Luis,Cruz-Hernández María Antonia,Mendoza-Herrera Alberto
Abstract
El objetivo de este trabajo fue identificar en el genoma de Candidatus Liberibacter asiaticus (CLas), proteínas de membrana externa con potencial para el desarrollo y optimización de un método de detección inmunoenzimático. El estudio se realizó durante 2019 y se utilizó el servidor web Predict Protein, así como las bases de datos HhPred/HhSearch y Pfam. Se detectaron 52 proteínas de membrana externa en el genoma completo de CLas, de las cuales, 11 no habían sido caracterizadas previamente. Los análisis predictivos realizados en la proteína B8Y674 generaron ocho posibles epítopos y cuatro de ellos evaluados experimentalmente en células B, mostraron porcentajes de identidad entre 80 a 90%. Se detectó a CLas mediante PCR-punto final a partir del ADN extraído de limón mexicano con síntomas de Huanglongbing utilizando iniciadores diseñados sobre la secuencia del gen Omp que codifica para la proteína B8Y674 y se registró 95% de identidad entre las secuencias generadas y secuencias de CLas previamente reportadas. Los resultados obtenidos nos permiten inferir que la proteína B8Y674 es un candidato potencial para ser utilizada en la detección inmunoenzimática de CLas.
Publisher
Revista Mexicana de Ciencias Agricolas
Subject
General Earth and Planetary Sciences,General Environmental Science
Reference18 articles.
1. Achor, D. S.; Welker, S.; Ben-Mahmoud, S.; Wang, C.; Folimonova. S. Y.; Dutt, M.; Gowda, S. and Levy, A. 2020. Dynamics of Candidatus Liberibacter asiaticus movement and sieve pore plugging in citrus sink cells. Plant Physiol. 182(2):882-891. Doi: 10.1104/pp.19.01391.
2. Andrade, M. O.; Pang, Z.; Achor, D. S.; Wang, H.; Yao, T.; Singer, B. H. and Wang, N. 2020. The flagella of “Candidatus Liberibacter asiaticus” and its movement in planta. Molecular plant pathology. 21(1):109-123. Doi: 10.1111/mpp.12884.
3. Bastianel, C.; Garnier-Semancik, M.; Renaudin, J.; Bové, J. M. and Eveillard, S. 2005. Diversity of “Candidatus Liberibacter asiaticus,” based on the omp gene sequence. Appl. Environ. Microbiol. 71(11):6473-6478. Doi: 10.1128/AEM.71.11.6473-6478.2005.
4. Carrizo, A.; Brihuega, B.; Etchechoury, I.; Arese, A.; Romero, S.; Gioffré, A., Romano, M. F. and Caimi, K. 2009. Identification of immunoreactive antigens of Leptospira interrogans. Rev. Argentina de Microbiol. 41(3):129-133.
5. Chen, J.; Deng, X.; Sun, X.; Jones, D.; Irey, M. and Civerolo, E. 2010. Guangdong and Florida populations of ‘Candidatus Liberibacter asiaticus’ distinguished by a genomic locus with short tandem repeats. Phytopathology. 100(6):567-572. Doi: 10.1094/PHYTO-100-6-0567.
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