1. Centre International de Recherche en Infectiologie (CIRI), INSERM, U1111, Université Claude Bernard Lyon 1, CNRS, UMR5308, École Normale Supérieure de Lyon, Université de Lyon, Villeurbanne, France
2. Université de Lyon, VetAgro Sup, Marcy l’Etoile, France
3. UMR CNRS 5558, Laboratoire de Biométrie et Biologie Évolutive (LBBE), Université Claude Bernard Lyon 1, Villeurbanne, France
4. French National Reference Center for Antibiotic Resistance, University Hospital of Besançon, Besançon, France
5. UMR6249, CNRS Chrono-Environnement, Franche-Comté University, Besançon, France