Detecting selection along environmental gradients: analysis of eight methods and their effectiveness for outbreeding and selfing populations

Author:

De Mita Stéphane,Thuillet Anne-Céline1,Gay Laurène2,Ahmadi Nourollah3,Manel Stéphanie4,Ronfort Joëlle3,Vigouroux Yves1

Affiliation:

1. Institut de Recherche pour le Développement; UMR Diversité; Adaptation et Développement des Plantes (DIADE); Avenue Agropolis, BP 64501; 34394; Montpellier Cedex 5; France

2. Institut National de la Recherche Agronomique; UMR Amélioration Génétique et Adaptation des Plantes tropicales et méditerranéennes (AGAP); INRA 2 Place P. Viala; 34060; Montpellier; France

3. Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement; UMR Amélioration Génétique et Adaptation des Plantes tropicales et méditerranéennes (AGAP); Avenue Agropolis; 34398; Montpellier Cedex 5; France

4. Université Aix-Marseille I; UMR Laboratoire Population Environnement Développement (LPED); 3 place Victor Hugo; 13331; Marseille cedex 3; France

Publisher

Wiley

Subject

Genetics,Ecology, Evolution, Behavior and Systematics

Reference51 articles.

1. Molecular spandrels: tests of adaptation at the genetic level;Barrett;Nature Reviews Genetics,2011

2. Identifying adaptive genetic divergence among populations from genome scans;Beaumont;Molecular Ecology,2004

3. Evaluating loci for use in the genetic analysis of population structure;Beaumont;Proceedings of the Royal Society of London Series B-Biological Sciences,1996

4. Controlling the false discovery rate-a practical and powerful approach to multiple testing;Benjamini;Journal of the Royal Statistical Society series B-Methodological,1995

5. The distinctive footprints of local hitchhiking in a varied environment and global hitchhiking in a subdivided population;Bierne;Evolution,2011

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